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番茄白粉病菌钙调蛋白基因的克隆与分析 第3页

更新时间:2016-9-11:  来源:毕业论文
1.2 试验方法
1.2.1 引物的设计与合成
研究发现,各物种钙调蛋白都具有钙离子结合位点的共同特征,在所有真核生物中钙调蛋白都具有高度的保守性[12-13]。根据GenBank登录获取已知的稻瘟病菌、玉米大斑病菌、炭疽病菌等6种病原真菌CaM基因氨基酸序列的保守区域EFKEAFS和YNEFAQC设计的1对寡核苷酸简并引物(表1)。PCR引物合成由南京金斯瑞生物科技有限公司完成。
表1引物序列
N0 Oligo sequence (from 5' end to 3' end)
R
F GARTTCAAGGAGGCCTTCTC
CTGGACRAAYTCGTYGTA
1.2.2 番茄白粉病菌gDNA的提取
采用改良后的真菌gDNA提取方法提取白粉病菌的gDNA,具体方法如下:
(1) 用毛刷轻轻刷取适量受感染叶片上的菌丝于研钵中,加入与菌体粉末等体积的石英砂和适量的2% CTAB抽提液迅速研磨破碎细胞,每个EP管中分装500µL菌液。然后液氮中速冻30s,立即65℃水浴30s,反复3次,在漩涡振荡器上高速漩涡4~5min,之后于65℃水浴40min,每10min摇匀;
(2) 加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(体积比25:24:1),振荡摇匀,12000rpm离心10min;
(3) 取上清(为避免沉淀的吸入,可以再离心一次),然后加上清液1/10体积的10% CTAB抽提液,振荡后加等体积氯仿/异戊醇(体积比24:1),振荡混匀,12000rpm离心10min;
(4) 取上清液,加入等体积的异丙醇,轻柔混匀,-80℃放置30min后12000rpm离心15min;
(5) 弃上清,加800µL预冷的75%酒精洗涤沉淀,然后12000rpm离心5min;
(6) 弃上清,将沉淀于超净工作台上风干;
(7) 加适量无菌去离子水溶解沉淀,-20℃存放备用。
1.2.3 PCR扩增目的基因
PCR反应体系:DNA模板1μL,上下游引物各2μL,2×Taq Master Mix 10μL,加双蒸水至20μL。PCR反应条件:94℃预变性5min;94℃变性30s,47℃退火45s,72℃延伸60s,37个循环;72℃再延伸5min。取样品3μL进行琼脂糖电泳,观察电泳结果。然后大量扩增并经SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒回收PCR产物。
1.2.4 pMD18-T载体与目的基因的连接反应
具体操作依据pMD18-T载体说明书进行。
1.2.5 感受态细胞的制备和目的基因的转化
操作依据分子克隆实验指南[14]。
1.2.6 重组载体的PCR鉴定
使用高纯度质粒小量快速提取试剂盒提取重组载体。分别采用重组质粒和纯水为模板进行PCR反应,所用引物及PCR条件同1.2.3。初步检测构建的重组质粒中是否含有目的基因片段。

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