Bacillus xylanase gene的DNAMAN引物设计
设计（论文）的主要内容（技术指标）与要求：
主要内容： 在NCBI 上搜索相关基因，用DNAMAN软件设计引物。
要求： 熟练引物设计的要求和步骤，能成功设计引物。
一、立题依据(国内外研究进展或选题背景、研究意义等)
在整个PCR体系中, 引物占有十分重要的地位。PCR的特异性要求引物与靶DNA特异结合，不与其他非目的DNA结合，PCR的灵敏性要求DNA聚合酶能对引物进行有效的延伸，可见引物设计好坏与PCR结果密切相关。把设计好的两条引物用于杆菌木聚糖酶基因的PCR,用凝胶电泳检测扩增结果，以判断引物设计的好坏。
二、研究的主要内容及预期目标
能熟练使用NCBI和DNAMAN软件设计引物，能成功设计芽孢杆菌属木聚糖酶基因的引物。
三、研究方案（思路）
1 序列查找原文请找腾讯752018766优,文-论'文.网http://www.youerw.com
2系列同源性比较
3引物设计筛选及设计结果
四、论文进度安排
1、查阅相关资料 3月10号—4月10号
2、学会使用NCBI查找基因序列和DNAMAN软件设计引物 4月10号—4月30号
3、设计杆菌属木聚糖酶基因的引物 4月30号—5月15号
4、论文写作及修改 5月15号—5月25号
5、论文答辩 6月2号
目录
摘要1
关键词1
Abstract 1
Key word1
引言1
1引物设计基本原则2
2引物设计步骤及结果3
3讨论3
参考文献3
致谢4
生物工程专业学生 杨兴东
指导教师 孙迅
摘要：在NCBI上搜索Bacillus xylanase gene, 借助DNAMAN软件设计引物。
关键词：NCBI, 芽孢杆菌属木聚糖酶基因, DNAMAN软件
Primers design of xylanase gene in Bacillus
Student majoring in Biotechnology Yang Xing dong
Tutor Sun xun
Abstract ：In the NCBI search Bacillus xylanase gene, primers were designed using DNAMAN Software
Key word：NCBI, Bacillus xylanase gene, DNAMAN Software
引言原文请找腾讯752018766优,文-论'文.网http://www.youerw.com
木聚糖酶在自然界分布相当广泛，在海洋及陆地细菌、海洋藻类、真菌和反刍动物瘤胃、蜗牛、甲壳动物、陆地植物组织和各种无脊椎动物中都存在。已报道的能产木聚糖酶的微生物有细菌、链霉菌、曲霉、青霉和木霉等，人们研究和应用最多的是细菌、曲霉和木霉所产的木聚糖酶。由于其在造纸、食品和饲料等行业中潜在的应用前景，近年来越来越多的研究者对它进行了广泛而深入的研究。[7]本论文工作主要是尝试设计用于PCR扩增芽孢杆菌属木聚糖酶基因的引物。
1 引物设计基本原则[9]
PCR引物设计的目的是找到一对合适的核苷酸片段，使其能有效地扩增模板DNA序列。引物的优劣直接关系到PCR的特异性及成功与否。对引物的设计不可能有一种包罗万象的规则确保PCR的成功，但遵循某些原则，将有助于引物的设计。
①应用核酸序列保守区设计并具有特异性
设计引物之前，必须分析待测靶序列的性质，选择高度保守、碱基分布均匀的区域进行引物设计。引物与非特异扩增序列的同源性不要超过70%或有连续8个互补碱基同源。
②避开产物的二级结构区
某些引物无效的主要原因是引物重复区DNA二级结构的影响，选择扩增片段时最好避开二级结构区域。用有关计算机软件可以预测估计mRNA的稳定二级结构，有助于选择模板。1833