脂肪酶的高效性：酶催化反应的高效率与其能大幅度降低反应的活化能有关。在一个化学反应体系当中，每个分子所含的能量都是不同的，只有具有较高能量、处于活化状态的分子，即活化分子才能在分子碰撞时发生化学反应，在反应体系的所有反应物中活化分子所占的比例越高，整个反应的速率就越快。反应体系的活化能越高，那么反应体系中被活化的分子数越少，反应速率也就越慢。然而催化剂可以与反应物结合，形成过渡态化合物，降低了反应的活化能，从而加快了反应速率。与非酶催化剂相比，酶可以更多的降低催化过程中的活化能。
脂肪酶的专一性：指的是酶对催化的化学反应和参与反应过程的底物有严格的选择性，就是说一种酶只可以催化一种或是一类化学反应，只对一种或结构相似的一类底物发生作用。一般的催化剂没有这样严格的选择性，不同的蛋白酶只可以催化蛋白质中与其相对应肽键的水解，不同的脂肪酶只可以催化脂肪中与其相关酯键的水解反应。脂肪酶对于催化条件的专一性是酶类尤其关键的特性之一，与一般催化剂相比，这也是它们最主要的差异。不同的酶专一性不同，有的酶只能作用于一种底物，当底物结构有细微变化时，酶就起不到催化作用了。
在手性合成和研究领域范围中，对映选择性是酶类的一个非常重要的参数，因为它所反映出的是R/S两种手性底物分子在被酶催化时所表现出的选择效果，而脂肪酶就是这么一种手性分子，这种效果与许多方面的因素有关，比如：pH，反应溶剂，水活度，温度等，手性是用来衡量在一定条件下酶对两种异构体的识别能力 南极假丝酵母脂肪酶的分子模拟(3):http://www.youerw.com/huaxue/lunwen_28399.html