摘要：玉米作为人类最重要的农作物之一。长期以来,它都是人类维持生存的基本食物和主要的动物饲料原料，是全世界总产量最高的农作物。因此，玉米基因组信息挖掘与分析对于玉米功能基因组学的发展具有重要意义。
SBP家族基因是植物特有的一类转录因子，在植物生长、发育及多种生理生化过程发挥重要作用。为了更好地了解玉米SBP家族基因的生物学功能，采用生物信息学方法对玉米SBP家族基因进行一系列分析。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与玉米基因组数据对比，并设置一些严格的筛选标准，从玉米SBP基因组中挖掘一些SBP转录因子，系统发育分析显示，单子叶植物玉米和水稻的SBP基因保守性更强、亲缘关系更近。通过基因分析注释以及启动子功能预测, 进一步发现 SBP 家族基因参与植物生长发育、形态建成、逆境胁迫响应、花器官发育以及植物光反应等过程。并且, 玉米 SBP 转录因子可通过参与赤霉素、生长素、脱落酸、水杨酸等多条激素信号调控途径来调节植物的生长发育。92925
毕业论文关键词：玉米，SBP家族基因，转录因子，生物信息学
Abstract:Maize as one of the most important crops of mankind。 For a long time, maize is the ba-sic food for the survival and the main animal feedstuffs,and the highest total crop in the world。 T- herefore, maize genome information mining and analysis is of great significance to the develop- ment of maize functional genomics。
SBP family gene is known to be unique in plants, which plays an important role in plant grow- th and development, as well as many physiological and biochemical processes。 In order to under- sand the biological function of the SBP family gene, the bioinformatics method was used to anal- yze the maize SBP family gene。 In this study, based on homology alignment technology, we alig- ned all known SBP TFs from Arabidopsis and Oryza sativa with those from maize genome sequ- ence to mine novel SBP TFs in maize。 Phylogenetic analysis indicated that SBP transcription fa- ctor genes have stronger homology, especially between Zea mays and Oryza sativa。 Moreover, p- romoters-cis elements analysis of those SBP TFs demonstrated that they might be in-volved in p- lant growth and development, morphogenesis, adversity response, the development of flower or- gans and photosynthe-sis。 It is probable that SBP TFs regulate plant growth and development th- rough the multiple hormone of signaling transduction pathway, such as gibberellin, auxin, absci- sic acid, and salicylic acid。
Keyword: maize,SBP family, genetranscription factor,bioinformatics
目 录
1 研究背景及进展 4
1。1 研究背景 4
1。1。1 SBP转录因子 4
1。1。2 SBP家族基因的结构特征 4
1。1。3 SBP家族基因的功能 5
1。2 SBP转录因子的研究进展 5
2 材料与方法 6
2。1 材料 6
2。2 玉米SBP家族基因的鉴定 6
2。3 玉米SBP转录因子的分类 6
2。4 玉米SBP转录因子的系统发育关系 7
2。5 玉米SBP转录因子家族基因的在线分析 7
2。6 玉米SBP转录因子的表达模式分析 玉米SBP家族基因功能预测及其生物信息学分析:http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_200674.html