根据上述探索,本课题对大量商品猪进行采样分析并进行基因测序与数据处理,筛选出GR基因可能存在的突变位点,并根据该位点进行引物设计,利用ASPCR技术进行突变位点分型,再根据分型结果与商品猪背腰最长肌肉内脂肪含量进行比对,最后根据比对结果进行统计学分析以确定GR基因突变位点是否与肌内脂肪沉积量有相关性。
1.实验材料与方法
1.1实验材料
1.1.1实验动物
本研究实验动物来自同一条件下饲养的杜长大,二花脸商品猪,将其颈动脉放血屠宰后,立即取背最长肌肌肉与其周围皮下脂肪组织,组织离体后立刻放入液氮罐保存。在实验室进行肌内脂肪含量测定。挑选体重约80kg商品猪150头,并对背腰最长肌进行手术分离用于DNA提取。
1.1.2实验主要试剂
Trizol;氯仿;异丙醇;乙醇;BSP试剂盒,10%TBE溶液;硼酸55g;0.5molEDTA(pH8.0)40ml;冰醋酸;核酸染液。
1.1.3主要仪器
低温高速离心机、移液枪;立式压力蒸汽灭菌器;紫外分光光度计;PCR仪;水浴锅;超净台;凝胶成像系统;电子天平;索氏抽提器,滤纸;干燥器;粉碎机,坩埚。
1.2实验方法
1.2.1组织DNA提取与肌内脂肪含量测定手术法分离背腰最长肌,提取肌肉组织的DNA,具体方法如下:1)将肌肉组织液氮速冻碾碎,置于2ml离心管中。
2)加入900ml裂解液,及30μl蛋白酶K,摇匀。
3)置于55℃水浴锅孵育过夜(加封口膜防水),直至管中无组织样液体清亮。
4)每管加入等体积(900μl)饱和酚,摇匀器上室温摇匀15分钟,10000转/分4℃离心10-15分钟。
5)取上清,置于新的2ml离心管中,加500μl饱和酚,500μl氯仿(氯仿:异戊醇=24:1),室温混摇15分钟,10000转/分4℃离心10-15分钟。
6)取上清,置于新的2ml离心管中,加等体积的纯氯仿,室温混摇15分钟,10000转/分4℃离心10-15分钟。
7)取上清,置于1.5ml离心管中,加入800μl无水乙醇,室温混摇15分钟,10000转/分4℃离心10-15分钟。
8)弃上清,加入1ml70%的乙醇洗涤,10000转/分4℃离心10-15分钟。
9)重复步骤8
10)空离2分钟,吸干剩余乙醇,通风处内风干,加灭菌水溶解(提前55℃预热),
-20℃保存。手术法分离背腰最长肌,测定肌肉组织的肌内脂肪含量,具体方法如下:
1)将肌肉样品放入坩埚中剪碎,然后把装有碎肌肉样品的坩埚放入烘箱中,103℃烘6小时。
2)将烘好的坩埚放入干燥器中冷却0.5小时,取出坩埚中的肌肉样品放入微型粉碎机内粉碎,将粉碎的肌肉粉末放入小自封袋中干燥保存。
3)将滤纸切成8厘米正方形纸片,精确称取1到2克肌肉粉末,(记做W1)用滤纸方块包好。
4)将滤纸包放入烘箱95到105℃过夜烘干后放入干燥器中冷却半小时后称重并记录下重量,称量后再次放入烘箱中以相同温度烘1到2小时后放入干燥器中冷却半小时后称重,直到两次差值在千分之一,记下重量W2。
5)将滤纸包放入索氏抽提器中浸泡过夜,接通冷凝水流,在恒温水浴锅中进行抽提,调节水温至55到70℃,使冷凝下滴的乙醚成连珠状,抽提至抽取筒内的乙醚用滤纸点滴检查无油迹为止。
6)抽提完毕后取出滤纸包在通风处挥发完乙醚以后放入烘箱95到105℃烘2小时,
放入干燥器中冷却并记录数据,称量后再次放入烘箱中以相同温度烘1小时后放入干燥器中冷却半小时后称量,直到两次差值在千分之一以内,记下W3。
7)利用计算公式:粗脂肪含量(%)=(W2-W3)/W1可计算粗脂肪含量。 糖皮质激素受体基因与肌内脂肪相关性的探究(3):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_205220.html