研究发现湿地植物的根系也能从污水中吸附并富集中金属元素和部分的有毒有害的物质。例如:Cu、Cd等一些重金属元素和油类主要分布在根部。利用垂直潜流人工湿地来处理低浓度的重金属污水，试验结果证明湿地植物能吸收并富集富集水体中百分之三十左右的铜和锰，此外锌、镐、铅的富集也在百分之五到百分之十五之间。不同的植物种类富集的重金属和一些的有毒物质和有害物质的能力不同。有许多种类的陆生植物具有超强的富集重金属元素的能力，植物体内的金属含量一般可以达到百分之零点一至百分之一之间不等。除了能从自然界寻找具有超高吸收、富集和积累能力的植物种类以外，由于现代技术的发展，很多研究者正在尝试和开放具有超强吸收、富集和积累能力的新型转基因品种植物。
 植物通过将氧气释放到根区，从而对基质的氧化还原造成电位影响来影响基质中的生物化学循环。湿地环境对地球上很多的生物来说是一种严酷的生长环境，因为湿地土壤缺少氧气这是对生物生存最严酷的条件。缺氧的情况下，生物无法进行正常的有氧呼吸，因此还原态的某些元素和有机物很有可能达到有毒的水平。在人工湿地中的植物能够将光合作用产生的氧气通过植物的气道输送到植物的根区，从而在植物的根区的还原介质中形成氧化态的微环境。使得这种根区的有氧区域和无氧区域的共同存在为好痒、兼氧和厌氧生物提供了各自适宜的环境状态，让不同的微生物各得其所，发挥各自应有的作用。好氧区域和厌氧区域的同时存在为硝化反应和反硝化反应以及其他污染物的转化创造了有利的条件。
 当然除了氧以外，根系统还能释放其他的物质。在更早期的研究中，德国的研究人员就曾证明，灯芯草的根部区域能够释放抗生素，当试验污水流经灯芯草植被后，一系列的细菌例如:大肠杆菌，沙门氏菌属和肠球菌的数量明显下降甚至消失。另外一些沉水的植物能释放复合物从而影响其它物种的生长。国内研究人员也曾有研究表明，石菖蒲具有克藻效应。植物通过根还能够释放很多的有机物，然而这种释放的数量目前还并不清楚。但是报道的值一般占光合作用固定碳的百分之十到百分之四十之间。然而在一些人工湿地的不同类型中，由于根分泌的这种有机碳又可以作为反硝化者的碳源从而增加硝酸盐的去率。
 在潜流人工湿地当中，基床中的水流一般通过活的根和根系或者死的根和根系在根区形成的沟道以及土壤间的缝隙。当根和根区进入生长时期的时候，它们能够起到疏松土壤的作用，当根和根区组织死亡腐烂之后，会留下一些孔或者沟，这些孔或者沟被认为在一定的程度上增加并且稳定了土壤的水力传导性作用。根据研究结果标本，即使是板结的土壤，在土壤的内部经过植物的根系的穿透作用之后，土壤的水力传输的能力也可以与砂砾，碎石相提并论。
 国内研究人员曾在1997年进行的人工湿地的污水处理中发现，植物在经过3个月到5个月的污水处理后，植物的生长能力会将加快，而且天然土壤的水力传输程度也会得到一定的提高，当植物正式成熟时，根区的水容量将会大大的增大。
     当然人工湿地用于污水处理和净化作用已经有较长的一段历史时间了，因为人工湿地的低能耗、技术简便易行、同时有具有良好的净化效果和其独特的生态功能从而成为了学术研究的热点。在人工湿地的系统中 ，植物的光合作用是植物生长和繁殖的能量来源，同时也是净化污水的能量来源。
          高浓度pb废水对水平潜流湿地中菖蒲抗氧化特性的影响(3):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_36042.html