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截形叶螨线粒体种群遗传结构与体内共生菌的关系研究(4)

时间:2022-06-27 21:41来源:毕业论文
1。5序列的测定及分析 对PCR扩增产物进行统一测序,由上海英潍捷基公司完成。 获得测序结果后,将结果整理置入Arlequin3。5中进行分析。 1。6截形叶螨种

1。5序列的测定及分析

对PCR扩增产物进行统一测序,由上海英潍捷基公司完成。

获得测序结果后,将结果整理置入Arlequin3。5中进行分析。

1。6截形叶螨种群遗传分化分析

本研究中,我们通过分子变异模型分析(Analysis of Molecular Variance,AMOVA)对截形叶螨自然种群的遗传分化模式进行了分析,通过对不同因素的分类方法,来研究Wolbachia以及地理因素对截形叶螨自然种群分化的影响。

2结果与分析

2。1不同地理种群截形叶螨mtDNA的单倍型分析

本研究中,通过对10个截形叶螨自然种群(表3)中的mtDNA-cytb的分析,得到基于不同地理分布的截形叶螨单倍型网络系统发育关系(表4、图2)。本研究中,我们共检测377头个体的mtDNA-cytb基因,发现共有10个单倍型(H1~H10)。

从图中可以明显的看到,不同的单倍型之间存在着较大的差异,碱基差异最大的HAP7和HAP10之间有6个碱基不同。在这10个不同的单倍型中,每个单倍型所包含的个体数也是不同的,表现为HAP1的个体数最多,HAP5次之,而HAP4、HAP6和HAP10最少。文献综述

2。2截形叶螨不同单倍型中Wolbachia的感染情况

在这10种不同的单倍型所包含的个体中,感染Wolbachia是比较普遍的,总感染率为29。7%。但是在不同的单倍型个体中,Wolbachia的感染情况不尽相同,存在一定的差异。总体来看,单倍型内的个体数越多,这些个体中的感染率就越高(图1)。

由于有些单倍型内的个体数较少,就个体数较多的HAP1、HAP2、HAP3和HAP5来看,当个体数较多时,总感染率可能会更高。

具体的感染情况见表4、表5。

2。3截形叶螨mtDNA多样性分析

在得到了这10种单倍型之后,我们便进行了单倍型多样性检测(表6)。结果显示,cytb的核苷酸多样性Pi平均值为0。00217,各个种群的核苷酸多样性在0。000(JCC、FQZ)-0。0016(HCZ)之间。cytb的单倍型多样性Hd品均值为0。678,各个种群的单倍型多样性在0。000(FQZ、JCC)-0。582(SCY)之间。

将所有单倍型分成感染与不感染Wolbachia两组再进行多样性分析是得到了这样的结果:感染来;自]优Y尔E论L文W网www.youerw.com +QQ752018766-的个体核苷酸多样性Pi平均值为0。00171,单倍型多样性Hd品均值为0。547,未感染的个体苷酸多样性Pi平均值为0。00235,单倍型多样性Hd品均值为0。716。两种多样性都是未感染的较高。

在每种地里种群内,Wolbachia的感染基本都降低了这两种多样性,但是在地里种群SCY中多样性不降反升了。这说明Wolbachia的影响是比较复杂的,不仅仅是降低或增加了多样性这么简单。

2。4中国截形叶螨自然种群的遗传分化分析

接下来,通过分子变异模型分析(AMOVA),对影响不同地里种群遗传分化的因素进行了初步探究。

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