摘要本文以分子动力学模拟技术为基础，以 CHARM 力场为基础，利用支持 CHARM 力场的 NAMD 软件以及辅助软件 VMD，对简单的单原子分子模型在不 同温度，不同相态下密度的物理性质，进行了模拟。68565

首先，探讨了模拟胞腔的设置方法以及物性的计算和统计方法，选取了适当 的分子数，建立了模拟界面的模型分析计算偶极大小。在计算机上成功编译了 NAMD 并进行测试。

其次，以 CHARM 力场为基础，研究了模拟的界面上的结构和性能。在分子 模拟得到的性能的基础上，分析了偶极对模拟结果的影响。

毕业论文关键词 分子动力学模拟 偶极 气液表面性质 界面模拟 密度

Title      Study of molecular dynamics simulation    between gas-liquid phase                           

Abstract

In this paper,we analysed the interaction between a model compound for molecular with the quantum chemical method.As well, we have used CHARM force field based on the use of gas molecules dissolved NAMD software polyethylene oxide acts carried out molecular simulations. 

Firstly,we explored the way to set up the statistical simulation cell cavity.And selected the appropriate number of molecules, the establishment of a model to simulate the interface analysis calculated dipole size. On the computer successfully compiled NAMD and tested.  

Secondly, CHARM force field, based on simulations to study the structure and properties of the interface. On the basis of the performance of the resulting molecular simulation, we analyze the impact of the dipole of the simulation results. 

Keywords  molecular dynamics; dipolar; molecular; density

目 次

1 绪论 1

1.1 量子化学(QM)方法 1

1.2 分子力学(MM)方法 4

1.3 分子蒙特卡罗似(MC)方法 7

1.4 分子动力学(MD)方法 8

2 分子间的作用力和势能模型 9

2.1 分子间的作用力 9

2.2 势能模型 9

2.3 多原子体系势能模型的获取 13

3 模拟界面技术 15

3.1 体系构成和演化方法 15

3.2 模拟胞腔的设置 16

3.3 物性计算和统计方法 16

4 电偶极子电场分布计算 18

5 分子模拟实验 20

5.1