摘要:DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase)是催化和维持DNA甲基化的一种催化剂。迄今已从拟南芥、水稻、玉米等多种植物中分离到各种DNA甲基转移酶的编码基因,其中研究最为透彻的是拟南芥,而在玉米中还少有报道。本研究采用生物信息学方法鉴定出玉米基因组中5个DNA甲基转移酶基因,并对其进行了分子进化和表达分析。基因复制分析表明,有1对基因起源于串联重复,1对基因起源于片段复制。系统发育分析显示,ZmMET蛋白可分为2个亚族,说明其成员已经发生了分化;在系统发育树的末端发现了2对旁系同源基因,说明物种特异性扩张是该家族进化的主要动力。基因表达模式分析表明,多数基因在各组织器官中均有表达。这些结果为ZmMET功能的深入研究奠定了基础。93568
毕业论文关键词:玉米,DNA甲基转移酶,系统发育分析,表达分析
Abstract: DNA methyltransferase is a catalyst for catalyzing and maintaining of DNA methylation。 To date, DNA methyltransferase genes have been isolated from many plant species such as Arabidopsis thaliana, rice and maize, among which the Arabidopsis DNA methyltransferase genes are the most studied。 However, little has been reported in maize。 In this study, 5 DNA methyltransferase genes in the maize genome were identified by bioinformatics approaches and comprehensive molecular evolution and expression analyses of these genes were conducted。 Gene duplication analysis showed that one pair each of genes originates from tandem duplication and segmental duplication, respectively。 Phylogenetic analysis showed that ZmMET proteins can be pided into two subfamilies, indicating that their members have perged。 Two pairs of paralogous genes were found at the terminal branches of the phylogenetic tree, indicating that species-specific expansion is the major force underlying the evolution of this family。 Gene expression pattern analysis showed that most ZmMET genes are expressed in various tissues and/or organs。 These results are useful for further functional research of ZmMET genes。
Key words: maize, DNA methyltransferase, phylogenetic analysis, expression analysis
目 录
1 前言。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。4
2 材料与方法。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。4
2。1 玉米DNA甲基转移酶基因家族成员的鉴定。。。。。。。。4
2。2 染色体分布和复制事件。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。5
2。3 系统发育分析。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。5
2。4 基因表达分析。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。5
3 结果与分析。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。5
3。1 玉米中的DNA甲基转移酶基因。。。。。。。。。。。。。。。5
3。2 ZmMET基因的染色体分布和复制事件。。。。。。。。。。。。。6
3。3 ZmMET系统发育分析。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。7
3。4 ZmMET基因表达分析。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。7
讨论。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。9
参考文献。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。10
致谢。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。11
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