鸭PRKAB1基因多态性研究(2)
2.2.2北京鸭PRKAB1基因座遗传结构及多态性指标分析 7
2.2.3 多态基因座PRKAB1与北京鸭饲料转化率的相关分析 8
2.3 北京鸭PRKAB1其他基因座结果与分析 9
3讨论 9
4结论及下一步工作 10
4.1 结论 10
4.2 下一步工作 10
致谢 11
参考文献 12
前言
北京鸭历史悠久, 是世界著名的肉鸭良种 因其早期生长速度快、肉质优良、适应范围广、抗病力强、繁殖力高等优点而受到国内外饲养者的欢迎[2]。饲料转化率，也叫料重比，即饲养牲畜或家禽增加一公斤体重所对应的饲料消耗量，饲料转化率的高低在很大程度上影响生产成本，所以对畜禽养殖户来说降低料重比能在很大程度上节约生产成本，达到生产效益最大化。
在以前的研究中我们使用的主要是传统的育种方法，但遗传进展慢，育种周期长，易受环境影响，仅仅通过对表型的测定不能准确反映基因型值。随着分子生物技术和基因工程技术的迅速发展，在畜禽遗传改良方面出现了许多新的技术方法，候选基因法[3-4]和基因组扫描是定位数量性状位点的方法，两种方法中候选基因法应用较多。本研究使用的就是候选基因法，先通过DNA测序看候选基因的位点上是否存在着多态性，若测序结果显示存在多态性，则可用于研究该多态性与我们要研究的目标性状之间是否有关联。利用DNA标记可直接选择具有上位效应和显性效应的基因，提高选种效率，从而加快育种进程[5]。
随着北京鸭育种工作的不断进展，其生长速度进一步提高，饲料转化率也不断提高，饲养周期逐步缩短[2]。 但是在集约化条件下，北京鸭和国外一些品种的鸭子等在胴体品质、肉用性、饲料转化率等方面都存在着差距[6]。为了能够更好利用北京鸭这一品种资源，提高资源利用率，为北京鸭生产提供科学依据，我们需要着重与饲料转化率密切相关的基因，我们所研究的AMPK家族基因变异可能与与饲料转化率存在着一定的联系，因此，本实验着重研究该家族中的PRKAB1基因。
AMPK(AMP-activated protein kinase)[7]即AMP激活的蛋白激酶 ，广泛存在于真核细胞生物中，是细胞内的能量感受器。该酶可以在细胞的能量代谢发生改变时，相应改变细胞内代谢途径以文持其能量平衡[8]。AMPK基因家族7个基因分别是PRKAA1、PRKAA2、PRKAB1、PRKAB2、PRKAG1、PRKAG2和PRKAG3，本实验研究的PRKAB1基因是编码AMPK的β1调节亚基的基因。已有实验证明PRKAB1&G2直接参与到糖原代谢[9]，所以本研究利用比较基因组学、基因工程、生物信息学及多种分子生物技术结合的方法，选择了与AMPK家族的β1调节亚基即PRKAB1基因作候选基因，对北京鸭的分子遗传基础进行分析，希望能够发现其变异与饲料转化率之间的关联性。我们通过进一步研究，可以发现与饲料转化率相关的其他的分子标记，并通过选育得到饲料转化率较高的群体，用于大面积养殖可节约成本。
1材料与方法
1.1 试验材料
1.1.1 试验动物样本
本试验所用到的样品来自中国农业科学院北京畜牧兽医研究所建立的北京鸭资源群体。
1.1.2 试验主要试剂
1.1.2.1 普通试剂
柠檬酸，柠檬酸钠，葡萄糖，Tris•Cl，EDTA，NaCl，NaOH，Tris饱和酚，氯仿，异戊醇，无水乙醇，SDS，EB，溴酚蓝，甘油，丙烯酰胺，乙酸，硝酸，硝酸银，TEMED，无水碳酸钠，甲醛，琼脂糖等。
1.1.2.2 生化试剂与分子生物学试剂