一株潜在新种放线菌的多相分类学研究
毕业论文关键词：根际放线菌；多相分类；新物种；16S rRNA 基因
Study on the polyphasic taxonomy of a potential new actinomycete strain
Abstract: With the rapid development of biotechnology, some new actinomycetes have beendiscovered, but there are still few known actinomycetes strains. Thus, there still exist a largenumber of actinomycetes yet to be discovered and exploited in nature. This paper appliespolyphasic taxonomic approaches to identify a potential new actinobacterial strain KLBMPS0039 isolated from rhizosphere soils. Based on the cultural, morphological and physiologicalfeatures, biochemical tests, chemical classification characteristics (fatty acids, polar lipids,quinone components, the mole proportion of G + C) and 16S rRNA gene phylogeneticanalysis compared with type strains KLBMP S0043T, NBRC 15531T and SBHR OA6T. Theresults showed that strain KLBMP S0039 was a member of the genus Nocardia and hadobvious differences in physiological and biochemical features. Thus, strain KLBMP S0039could be classified as a potential new species of the genus Nocardia.
Keywords: Rhizosphere actinomycetes; polyphasic taxonomy; new species; 16S rRNA gene
目录
前言1
1.材料与方法.3
1.1供试材料..3
1.1.1实验菌株...3
1.2实验仪器.3
1.3实验方法..3
1.3.1形态和培养特征.3
1.3.2生理生化特征.3
1.3.3化学分类特征.4
1.3.4分子分类..5
2.结果分析.7
2.1.菌株KLBMPS0039T的形态和培养特征...7
2.2菌株KLBMPS0039T生理生化实验结果...7
2.3菌株KLBMPS0039T化学分类结果9
2.1.4菌株KLBMPS0039T分子分类结果11
2.1.5菌株菌株KLBMPS0039T分类鉴定结果12
2.1.6对诺卡氏菌的描述12
3.讨论...13
致谢..14
参考文献..15
前言放线菌是一类高G+C 含量的革兰氏阳性细菌，存在于地球上的各种生态环境中，能产生多种生物活性物质，例如抗肿瘤药物、植物病原真菌抑制剂，或者是免疫制剂、抗生素，细胞分裂以及消炎药等[1,2]。随着人类在生活中普遍使用放线菌，使其产生了巨大的市场经济价值。由于放线菌能够产生大量的生物活性物质，其中包含大量抗生素，使其具有较强的生物修复能力[3-5]，目前有 66%左右的抗生素在林业、农业和临床医学中被广泛应用[6]。在1906 年， Waksman 和一些学者发现了放线菌可以产生链霉素， 从此之后，药学家与微生物学家开始广泛的把目光放在了放线菌上[7]。时至今日，科学家从微生物中发现了三万多种有生物活性的次级代谢产物， 其中的 50%以上都来自于放线菌，发现的近万种抗生素中有 75%是由放线菌产出的。放线菌还是产生氨基酸、除草剂、维生素、抗寄生虫剂、酶以及酶的抑制剂等药物的重要微生物资源，并且被科学家广泛应用于甾体药物的生物转化。近几年，科学家们又发现了一种海洋放线菌，它可以产生免疫调节活性多糖。所以，人类开始大力开发与应用这些有益于人类的代谢产物并且在广泛应用于各种领域， 也产生了巨大的经济价值，包括应用于农业、医疗、工业、国防以及食品等领域[8,9]。起初，科学家们主要研究放线菌中链霉菌的代谢产物，但是随着研究的逐步深入，发现从链霉菌中发现新化合物逐渐减少[10]。由于我国科学家对稀有放线菌资源不够重视，近几年才开始投入时间与精力研究， 而且我们也可以从新物种中发现新的活性物质， 因而，不光我国，全世界都对稀有放线菌的研究和开发极其重视。我国国土面积大，气候、地形多样，放线菌的数量和种类丰富，因此我国应该大力开发与深入研究稀有放线菌[11]。植物根际是一种特殊的生态环境，大量的微生物生长在其中，根际微生物与非根际微生物的区别主要集中于微生物数量和种类。大量研究表明，科学家从根际微生态环境中分离得到许多微生物，并且其中大多数都具有重要的生物活性，因而，大量科学家开始研究与开发植物根际微生物[12]。植物根际与其周围的土壤微域构成一个极其特殊的微生态环境[13]。