摘要：Trihelix转录因子家族的命名主要是因为有3个连续的α螺旋在其保守结构域，该家族也被称为GT因子家族，因为最开始该家族被研究发现能与光应答元件即GT元件特异性结合而得此名称。Trihelix转录因子家族在植物生长发育过程中以及对逆境的抗性具有重要的作用。本文利用已经公布的玉米Trihelix转录因子家族的数据库，采用生物信息学的方法对其进行简单的鉴定获得基本信息、系统进化关系、保守motif和Trihelix转录因子家族在水稻、短柄草和高粱中的同源性关系进行分析。对玉米Trihelix类型基因的系统分析，将有利于Trihelix转录因子家族功能的进一步研究。71510

毕业论文关键词：玉米，Trihelix，转录因子家族，生物信息学

Abstract: Trihelix transcription factor family had been known for it’s conserved domain containing three continuous helix, The family was first discovered that it can bind specifically with the light response element named as GT element. The Trihelix transcription factor family plays an important role in stress response and plant growth, development. This study used published Trihelix transcription factor family of maize from database, and analyzes structure of gene for simple information、phylogenetic relationships、conserved motif in genome-wide of Trihelix gene and homologous relationship among Rice、False bromegrass and Sorghum in Trihelix transcription factor family by bioinformatic tools. The analysis to Trihelix gene of maize will be helpful to further study of biological function of the Trihelix transcription factor family.

Keywords: maize, trihelix, transcription factor family, bioinformatic

目录

1 前言．6

1.1生物信息学简介6

1.2 转录因子的概念．6

1.3 TRIHELIX转录因子家族的分类．6

1.4 TRIHELIX转录因子的结构特点．6

1.4.1 TRIHELIX保守结构域．7

1.4.2 第四α螺旋结构域．7

1.4.3 卷曲螺旋结构域．7

1.5 TRIHELIX转录因子的功能．7

1.5.1 TRIHELIX转录因子与光应答．7

1.5.2 TRIHELIX转录因子对植物生长发育的影响．8

1.5.3 TRIHELIX转录因子在生物胁迫中的作用．8

2 材料与方法．8

2.1 TRIHELIX转录因子家族的数据获取与分析．8

2.2 TRIHELIX蛋白系统的进化树的构建．9

2.3 TRIHELIX保守结构域的鉴定与分析9

2.4 TRIHELIX转录因子家族在玉米、短柄草、高粱和水稻中的同源性分析9

3 结果与分析．9

3.1 玉米TRIHELIX转录因子家族的鉴定9

3.2 玉米TRIHELIX转录因子的进化分析11

3.3 玉米TRIHELIX家族全长蛋白的结构性分析．13

3.4 玉米TRIHELIX转录因子家族在染色体上的位置分布14

3.5 玉米TRIHELIX转录因子在玉米、短柄草、高粱和水稻中染色体复制分析15

结论19

参考文献20

1. 前言

1.1 生物信息学简介

生物信息学是一门新学科，主要是分子生物学与信息科学结合而成的，使用时需要借助计算机来收集、检索和分析生物信息。

根据研究的内容来说，生物信息学主要包含三个方面：一是研究相关的统计学方法和新算法，二是分析、解释与研究不同的数据结果，三是对数据新工具的高效利用和管理。生物信息学研究的目标也包括三部分：首先，在生物体中读取和了解DNA的遗传信息，从而获得基因组的基本信息，最后根据分析结果来解释基因组的各项性质；其次是发现并分析人体中生理和病理的分子基因，设定出合理有效的方法途径为人类各种疾病的诊断、治疗以及预防提供便利；最后是认识生命的本质和起源。生物信息学的研究材料是从各种数据库得来的大量生物学数据，研究工具是计算机设计的各种程序和软件，研究方法是对得到的生物学数据的利用、搜索和处理，结论是对数据结果进行分析和解释。