摘要：生长素在植物生长发育过程中起着非常重要的作用，它是植物中的一种特殊的激素，在植物生长发育的各个阶段都至关重要。近年来，对于植物体中ARF基因成为研究的热点问题，主要是由于表达的信号转导机制所导致的。在本论文中，我们利用生物信息学软件对玉米ARF基因家族的结构、保守结构域、系统进化和表达的系统进行分析，并对玉米和其他物种的同源性ARF基因进行分析。通过对ARF家族基因的综合分析，对于研究ARF基因的分子进化和分子克隆具有十分重要意义。根据数据库发布相关的玉米基因，再利用生物信息学方法对玉米ARF基因家族的结构，系统演化，保守结构域以及ARF转录因子基因家族在玉米、短柄草、高粱和玉米的同源性的关系进行了分析。通过研究，为未来的ARF转录因子在植物进化分析奠定了一定的基础。78915

毕业论文关键词：玉米；ARF转录因子；生物信息学；同源性分析

Abstract: Auxin plays a very important role in the process of plant growth and development, which is a special kind of hormone in plants。 And it is extremely important at every stage of plant growth and development。 In recent years, the ARF gene in plants has become a hot issue in the study of signal transduction and expression mechanism。 In this paper, the structure of the ARF type gene of maize was analyzed by bioinformatics software, the system evolution and expression analysis were carried out, and the homology of ARF gene of maize and other species were analyzed。 Comprehensive analysis of ARF gene family has important significance in studies of molecular cloning and evolution of ARF gene。 This article uses the maize genome sequence data with bioinformatics method for maize ARF gene family structure, the structure of the system evolution, the conservative domain and the ARF transcription factor family in maize, small grass, sorghum and maize homologous relationship are analyzed。 Through the research, it will be the foundation of analysis of ARF in plant evolution in the future。 

Key words: Maize; Transcription factors family; Bioinformatics; Homology analysis

目录

1  前言 6

1。1  生长素的概念 6

1。2  转录因子转录因子的概念 6

1。3  ARF转录因子的来源 6

1。4  ARF转录因子蛋白的分子结构 6

1。5  ARF转录因子家族报道的研究 7

1。6  ARF转录因子的功能 8

2  材料与方法 9

2。1  主要生物学数据库及软件概述 9

2。1。1  植物TFDB数据库 9

2。1。2  ClustalW程序 9

2。1。3  WebLogo程序 9

2。1。4  MEGA软件 9

2。1。5  基序查询软件—MEME软件 9

2。2  植物ARF家族转录因子的鉴定 9

2。2  蛋白序列的比对和ARF蛋白系统的进化分析 9

2。3  ARF保守结构域的鉴定和分析 9

2。4  ARF转录因子家族在玉米，短柄草，高粱和玉米中的同源性分析 9

3  结果和分析 10

3。1  ARF转录因子家族的鉴定