在克氏原螯虾群体遗传学方面,国内外专家都做出了杰出的贡献。Barbaresi等利用RAPD,mtDNA CO I以及SSR对北美及西欧的克氏原螯虾群体进行分析,揭示了克氏原螯虾12个群体之间的亲缘关系和迁移路线,阐明了克氏原螯虾具有较高的可变性[4]。彭刚等利用SSR对安徽巢湖、江苏洪泽湖和江西鄱阳湖3个克氏原螯虾野生群体遗传多样性进行分析,展示出目前长江流域这3个克氏原螯虾野生群体具有很高的遗传多样性,各群体的期望杂合度却依旧存在一定程度的差异[5]。并且大部分位点的基因型分布偏离了Hardy-Weinberg平衡,证明基因型频率在群体内部发生了较大的改变。Yue等用5个微卫星位点和mtDNA CO I基因探究江苏南京和浙江桐乡4个克氏原螯虾群体的遗传结构[6];刘炜在2008年在7个微卫星位点的基础上,研究了东部地区6个克氏原螯虾群体的遗传多样性及各群体间的亲缘关系[7]。文献综述
1。3 微卫星标记法在水产生物中的应用
在20 世纪八九十年代,多位科学家在研究过程中发现一种广泛存在的一种序列,至此,科学界上对微卫星有了更加深入的认知,并在PCR技术的基础上创造了更加方便的微卫星标记技术。微卫星标记法又称串联重复序列法,用少量的Nucleotide为单位进行多次串联重复组成的DNA序列。微卫星标记是核心序列和边侧的侧翼序列组成。侧翼序列将微卫星定在染色体的固定区域,核心序列则多次串联形成微卫星的多态性。
1。3。1 微卫星标记法的产生机制
现如今的科学界普遍认为微卫星的产生机理是DNA复制和修复过程中,滑动链的碱基跟互补链的碱基发生错配,从而使一个或多个的重复单位插入和缺失。从数理统计的角度看这个问题,微卫星的每次突变都会增加一个或多个的重复单位,这样就产生了新的等位基因。微卫星是活跃性很强的碱基序列有改变遗传物质的结构,调控基因,编码蛋白质等功能。
1。3。2 微卫星标记法的优点
(1)标记中性
标记无任何危害
(2)引物通用
侧翼序列具有保守性,某个物种的引物可以用整个族群。
(3)标记共显性
遵循共显性遗传,可以轻易分辨纯杂合子。
(4)检测方法简单
所需样本少,要求低,PCR结合电泳法即可检测。
(5)突变率低
微卫星的核心序列有高度的多态性,几乎不会产生突变。
(6)分布广
广泛分布在真核基因的内含子、非编码区和染色体上的任何区域。
1。3。3 水产生物的微卫星序列来源
(1)克隆法
可以通过随机克隆的方法获得,直接克隆DNA的微卫星,也可以筛选阳性进行克隆,再通过测序也可以获得微卫星序列。
(2)应用已公布的序列来`自+优-尔^论:文,网www.youerw.com +QQ752018766-
网络公布的的序列都可以查到为微卫星的序列,此方法的的PCR引物与各种条件都是已知的,在研究过程中相较其他方法更有优势。
(3)借用标记
此方法在国内研究水产生物应用普遍,但也存在两大弊端:一是引物筛选工作量大;二是可能会产生错误的结果。
1。3。4 微卫星在群体遗传学方面的应用
利用微卫星进行群体的遗传组成研究,必须要求群体样本的代表性、样本量及标记数的的合理,否则,最终结果与真实的遗传组成会产生巨大的差异。鲁翠云等设置5个标记量梯度、8个样本梯度,对大群体进行鱼类基因型分析和遗传参数统计。最终建议,用微卫星进行群体分析时,样本容量在45个以上,标记量应该在20个以上[8]。