植物内生菌的生境特殊性决定了内生菌具有理论研究的深度和广度，又有在生物防治方面的应用潜力，是个潜力巨大，但又尚待开发的微生物新资源。
1、 内生菌运用于生物防治的优点
自Pusey[19]首次使用B。subtilis防治桃褐腐病以来，生物防治逐渐成为一种控制果蔬采后病害的新途径被人们所重视。其优点可以归纳为五大点：一、安全、无残毒、无污染、不易产生抗药性[20]。二、植物内生菌不易受到外界环境的影响，可以较长时间发挥生物学作用。三、可以提高植物的抗病性[21]、抗逆性。四、可以作为外源基因的载体[22]。五、可以经受植物本生的防御机制。93181
2、 内生菌运用于生物防治的作用机制
内生菌的作用机制可以分为四大类：（1）与病原菌之间的营养或空间竞争。许多采后拮抗酵母菌生物防治的主要作用机制是营养与空间竞争，即微生物集群在水果伤口上，在生长位置上和关键的营养排斥病原微生物的生存，保护伤口，大大减少腐烂[23]。由于生防菌和病原菌争夺糖类、生长因子以及氮源等外源营养物质，从而抑制导致病原菌的孢子萌发及致病活动。（2）诱导寄主产生抗病性。诱导抗性的机制涉及到寄主、激发子和病原菌三者之间的相互作用关系，非常复杂，所以将其概括为四个方面：①诱导寄主产生大量抗病性的次生代谢物，如萜类物质和异黄酮类。②诱导寄主提高防御酶活力。拮抗菌诱导柑橘产生葡聚糖酶、几丁质酶从而增强其他防御酶类活性，这些酶类可以增强果皮抗性，分解病原菌的细胞壁，使病原菌胞质流出，死亡。③诱导改变寄主细胞组织结构。比如可以诱导宿主伤口处的细胞结构封闭，产生乳突状结构从而抑制病原菌的入侵[24]。④调节活性氧代谢。拮抗微生物可以通过诱导寄主体内活性氧代谢相关酶类的活性的提高来调节果蔬的抗病反应[25]。（3）对病原菌的直接寄生作用。拮抗菌通过对病原菌菌丝的缠绕、吸附生长、侵入、消解等形式抑制病原菌的生长。还有些拮抗菌附着在病原菌的菌丝体上从而形成对病原菌的直接寄生作用[26]。（4）产生抗生素或抗菌活性物质。植物内生菌作为生防菌的重要作用机理之一就是产生抗菌活性物质从而抑制植物病原菌的生长 [27,28]。内生细菌主要产生脂肽、葡聚糖酶、几丁质酶等物质；内生真菌产生主要产生生物碱类、脂肪族类、甾体类、肽类、萜类、酚类、醌类、异香豆素类的抗菌物质；抗生素类则主要内生放线菌由产生。抗菌物质产生后在植物体内留存、转运，对入侵的病原菌产生直接抑制作用[29]。
3、 内生菌对于采后果蔬防腐保鲜的作用
生物防治相比于冷藏和化学防治有着相当明显的优势。首先我国冷藏运输设备并不能普及，设备都比较昂贵，而且冷藏只能起到暂时一致的效果。随着社会对于绿色食品的追求，化学试剂的残留等问题也备受关注。内生菌以其安全、无残毒的特点将成为重要的防腐保鲜的手段。而一系列的研究也证明了内生菌的作用。纪丽莲等通过对芦竹内生真菌F0238的研究，表明其对番茄的保鲜作用与化学保鲜剂相当[30]；田建等通过对辣椒内生菌的研究，成功找到了炭疽病拮抗菌，并且其能明显降低辣椒失重率和腐烂率[31]；杨从军等从香蕉中分离纯化出5种菌，并通过鉴定发现其中四种菌具有进一步研究开发香蕉防腐保鲜荆和杀菌剂的潜力[32]；周金伟以湘粉一号番茄为试材，经过研究证明了内生菌011粗提液对采后番茄的保鲜效果[33]；袁志林等从百山祖冷杉针叶组织中分离到3株内生菌， 这些内生菌的固体发酵菌剂经过试验表明能有效防治油桃褐腐病菌、苹果轮纹病菌和草莓灰葡萄孢霉等引起的水果采后病害[34]。综上所述，内生菌对于采后果蔬的防腐保鲜有着明显的作用。其作用机理大致能归为两类。第一，内生菌通过抑制采后果蔬表面的致腐细菌以达到防腐的作用；第二，内生菌通过减小采后果蔬还原糖、维生素C、可溶性蛋白的降低，抑制O2- 的上升，保持细胞膜的完整性和提高了抗逆性酶活性等实现保鲜的功能[33]。 植物内生菌国内外研究现状综述:http://www.youerw.com/yanjiu/lunwen_200989.html