2.1 按杀菌剂的原料来源分：

1、有机硫杀菌剂如敌锈钠、福美锌、代森锰锌、福美双等。

2、有机磷、砷杀菌剂如退菌特、克瘟散、甲基立枯磷、乙磷铝等。

3、无机杀菌剂如石硫合剂、硫磺粉、氢氧化铜、石灰波尔多液、氧化亚铜等。

4、抗菌素类杀菌剂如农用链霉素、多抗霉素、春雷霉素等。

5、取代苯类杀菌剂如甲基托布津、百菌清、敌克松、五氯硝基苯等。

6、唑类杀菌剂如苯菌灵、噻菌灵、多菌灵、恶霉灵等。

7、复配杀菌剂如炭疽福美、双效灵、甲霜铜、甲基硫菌灵·锰锌、DT杀菌剂、拌种灵·锰锌等。

　　8、其他杀菌剂如敌菌灵、菌核利灭菌丹、克菌丹、福尔马林、腐霉利、扑海因、甲霜灵、霜霉威、瑞枯霉、喹菌酮等。

2.2 按杀菌剂的使用方式分：

　　1、保护剂在病原微生物没有接触植物或没浸入植物体之前，用药剂处理植物或周围环境，达到抑制病原，杀菌剂孢子萌发或杀死萌发的病原孢子，以保护植物免受其害，这种作用称为保护作用。具有此种作用的药剂为保护剂。如波尔多液、绿乳铜、百菌清等。

　　2、治疗剂病原微生物已经浸入植物体内，但植物表现病症处于潜伏期。药物从植物表皮渗人植物组织内部，经输导、扩散、或产生代谢物来杀死或抑制病原，使病株不再受害，并恢复健康。具有这种治疗作用的药剂称为治疗剂或化学治疗剂。如甲基托布津、多菌灵等。

　　3、铲除剂指植物感病后施药能直接杀死已侵入植物的病原物。具有这种铲除作用的药剂为铲除剂。如五氯酚钠、石硫合剂、福美砷等。

2.3 按传导特性分：

　　1、内吸性杀菌剂能被植物叶、茎、根、种子吸收进入植物体内，经植物体液输导、扩散、存留或产生代谢物，可防治一些深入到植物体内或种子胚乳内病害，以保护作物不受病原物的浸染或对已感病的植物进行治疗，因此具有治疗和保护作用。如霜疫清、乙磷铝、多霉清、甲基托布津、敌克松、噻菌铜、甲霜灵等。

2、非内吸性杀菌剂是指药剂不能被植物内吸并传导、存留。目前，大多数的品种都是非内吸性的杀菌剂，此类药剂不易使病原物产生抗药性，比较经济，但大多数都只具有保护作用，不能防治深入植物体内的病害。如硫酸锌、硫酸铜、百菌清、福美双等。

此外，杀菌剂还可根据使用方法分类，如土壤消毒剂、喷洒剂、种子处理剂等。