2。3 基因克隆
2。3。1黄瓜培养及RNA提取
将黄瓜种子放进干净的烧杯中,加超纯水漂洗15 min后去除干瘪的种子。超净台内将漂洗过的种子放进灭过菌的烧杯内,倒入10 ml 70%的酒精浸泡5 min;倒去酒精,再用10%的NaClO溶液浸泡20 min;倒去NaClO溶液,用无菌水冲洗种子5次,不时摇晃,每次2 min。将表面消毒的黄瓜种子接入pH 5。8的MS培养基,放置于28 ℃培养箱内暗培养2天,待种子露白后见光培养。
Trizol法提取黄瓜总RNA。将实验桌面、镊子、移液枪、保温瓶和刀片用75%酒精擦拭干净。剪取100 mg左右新鲜黄瓜叶片放置于已灭菌的匀浆器内,加入1 ml Trizol充分研磨。再将研磨液倒入预冷的1。5 ml离心管中,剧烈震荡混合4 min以上,室温放置6 min,再在4 ℃,12000 rpm离心10 min。吸取上层清液于新的预冷的1。5 ml离心管中,加入200 µl氯仿,剧烈摇晃5 min,室温放置至分层,4 ℃,12000 rpm离心10 min。重复上述步骤一次。吸取上层清液于新的离心管中,加入500 µl预冷的异丙醇,温和颠倒几次,室温放置约10 min,再在4 ℃,12000 rpm离心10 min。弃掉上清液,此时RNA沉淀于管底。用1 ml 75%乙醇清洗沉淀,4 ℃,12000 rpm离心5 min,室温放于超净台吹风10 min至略干燥呈半透明状。加入30 µl DEPC-H2O于管内溶解沉淀,于60 ℃恒温水浴锅水浴10 min。使用DNA酶去除RNA样品中残存的基因组DNA,如表2-1在试管中添加如下物质:文献综述
表2-1 溶解RNA的体系
全部溶解的RNA 20~50 μg
10×DNase I buffer 5 µl
DNase I (RNase-free 5 U/µl) 2 µl
RNase Inhibitor (40 U/μl) 0。5 µl
DEPC-H2O up to 50 μl
37 ℃恒温水浴30 min后加入80 µl的DEPC-H2O和等体积酚氯仿(1:1)于离心管中,混合均匀,4 ℃10000 rpm离心5 min。吸取上清液于新离心管,加入100 µl氯仿异戊醇(24:1),混匀后离心,转移上层水相。加入10 µl 3M 醋酸钠(pH 5。2)和250 µl预冷的无水乙醇于水相中,-20 ℃静置60 min,12000 rpm离心10 min获取沉淀。用70%乙醇清洗沉淀,并使沉淀干燥。加入适量的DEPC-H2O溶解,吸取1 µl用于检测RNA样品的纯度和浓度,另取2 µl跑1%的琼脂糖电泳,检测RNA的完整性。冻存于-80 ℃。
2。3。2 逆转录获取cDNA
使用SuperRT cDNA Kit,将RNA模板、Primer Mix、dNTP Mix、DTT、RT Buffer、RNase-Free Water和HiFi-MMLV溶化,置于冰上备用。依据表2-2配置反应所需体系,所有步骤均要求冰上操作,总体积为20 µl。
表2-2 逆转录获取cDNA的反应体系
成份 Ingredient 体积 Volume (µl) 终浓度
dNTP Mix,2。5 mM Each 4 µl 500 μM Each
Primer Mix 2 µl
RNA Template 2 µl 1 ng-5 μg
5×RT Buffer 4 µl 1×
DTT,0。1 M 2 µl 10 mM
HiFi-MMLV,200 U/μl 1 µl
RNase-Free Water 5 µl to 20 µl 黄瓜CsSPL基因的克隆和拟南芥转化(3):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_196526.html