摘要：DNA甲基化（DNA methylation）是一种在原核和真核生物中重要的遗传修饰方式，由DNA甲基转移酶催化。DNA甲基转移酶基因在玉米和水稻中已有较多的研究，而在拟南芥中还少有报道。本研究采用生物信息学方法鉴定出拟南芥基因组中6个AtMET基因，并对其进行了全面分析。基因复制分析表明，没有基因起源于片段复制、串联重复或逆转录转座事件。系统发育分析显示，该家族蛋白质可分为2个亚族，说明其成员已经发生了分化；在系统发育树的末端发现了1对旁系同源基因，说明物种特异性扩张是该家族进化的主要动力。基因表达模式分析表明，多数基因在2-3个组织器官中表达，AtMET2在各组织器官中未检测到表达。这些结果为拟南芥DNA甲基转移酶基因的功能分析奠定了基础。93179
毕业论文关键词：拟南芥，DNA甲基转移酶，系统发育分析，表达分析
Abstract: DNA methylation is an important genetic modification in both prokaryotes and eukaryotes, which is catalyzed by DNA methyltransferase。 DNA methyltransferase genes have been extensively studied in maize and rice; however, little is known in Arabidopsis thaliana。 In this study, 6 AtMET genes in Arabidopsis thaliana genome were identified using bioinformatics approaches and analyzed comprehensively。 Gene duplication analysis showed that no gene originates from segmental duplication, tandem duplication or retrotransposition。 Phylogenetic analysis revealed that the proteins of this family can be pided into two subfamilies, indicating that pergence has occurred among this family; one pair of paralogous genes was found at the terminal branches of the phylogenetic tree, suggesting that species-specific expansion contributed to the evolution of this family in Arabidopsis。 Gene expression analysis showed that most genes were expressed in two or three tissues; AtMET2 expression was not detected in all tissues examined。 These results lay the foundation for functional analysis of DNA methyltransferase genes in Arabidopsis thaliana。
Keywords: Arabidopsis thaliana, DNA methyltransferase, phylogenetic analysis, expression analysis
目 录
1 前言。4
2 材料与方法。4
2。1 基因家族成员的鉴定4
2。2 染色体分布与基因复制分析5
2。3 系统发育分析5
2。4 基因表达分析5
3 结果与分析。5
3。1 拟南芥中的DNA甲基转移酶基因。。5
3。2 DNA甲基转移酶基因染色体分布和复制事件。。6
3。3 拟南芥DNA甲基转移酶基因系统发育分析。6
3。4 拟南芥DNA甲基转移酶基因表达分析7
结论。8
参考文献。9
致谢10
1 前言来自优O尔P论R文T网WWw.YoueRw.com 加QQ7520`18766
DNA甲基化是一种在原核和真核生物中重要的遗传修饰方式，由DNA甲基转移酶催化。目前，在高等真核生物中只发现了DNA胞嘧啶5-甲基转移酶。甲基化的过程是以S-腺苷甲硫氨酸（SAM）作为甲基供体，将甲基转移到DNA碱基上。这个过程不会改变DNA的一级结构，并且在后代中可以稳定遗传。1964年，Gold和Hurwitz等[1]在Escherichia coli中鉴定出第一个DNA甲基转移酶。目前在哺乳动物中，已经发现4种DNA甲基转移酶。根据其结构和功能的差异，可以分为两大类：一种以Dnmt1为代表，主要作用是保持甲基化模式不变；另一种是以Dnmt3为代表，包括Dnmt3a、Dnmt3b以及Dnmt3L等，是主要的从头甲基化酶[2]。在过去的数十年里，DNA甲基化的发生机制已经得到深入研究，最具有代表性的是阐明了RNA介导的DNA甲基化（RNA-dependent DNA methylation, RdDM）机制。 拟南芥DNA甲基转移酶基因家族的鉴定和表达分析:http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_200986.html