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油菜素甾醇信号转录因子StBZR1基因的克隆及在马铃薯块茎形成中的初步功能分析

时间:2018-08-10 09:17来源:毕业论文
通过同源比对获得与拟南芥AtBZR1同源的基因StBZR1,利用生物信息学分析方法和相关分子克隆证实了马铃薯中存在BZR1转录因子,并通过组织特异性表达分析发现BZR1在根,茎,叶,匍匐茎和

摘要:油菜素甾醇(brassinosteroids,简称BRs)是第优尔大植物激素,调控植物生长和发育的许多过程。在马铃薯中,目前的研究尚未涉足油菜素甾醇信号通路。而BZR1作为一种重要的转录因子,在油菜素甾醇信号中具有不可或缺的作用。因此,本课题通过同源比对获得与拟南芥AtBZR1同源的基因StBZR1,利用生物信息学分析方法和相关分子克隆证实了马铃薯中存在BZR1转录因子,并通过组织特异性表达分析发现BZR1在根,茎,叶,匍匐茎和块茎中均有表达,推测其可能在马铃薯块茎形成中具有促进作用。这些结果为进一步研究其在马铃薯中的具体功能打下基础。26810
毕业论文关键词:StBZR1;基因克隆;块茎形成
The cloning and premary functional analysis of brassinosteroid signal transcription factor StBZR1 in potato tuberization
Abstract:BRs (brassinosteroids) are the sixth major plant hormones, which regulate many processes of plant growth and development. In potato, research of BR signal pathway is little reported, during which BZR1 plays a vital role as a transcription factor. Therefore, in our studies, we aligned and obtained the homologous gene of AtBZR1 in potato, which is named StBZR1. Further analysis using molecular cloning methods and bioinformatics confirmed the presence of BZR1 transcription factor in potato, and the tissue specific expression analysis showed that it can be expressed in roots, stems, leaves, stolons and tubers, which indicated StBZR1 may be involved in tuberization, and provided a base for further studies.
Key words:StBZR1;gene cloning;tuberization
目录
摘要:    4
关键词    4
Abstract    4
Key words    4
引    4
材料与方法    5
1.1  材料    5
1.1.1  植物材料    5
1.1.2  菌株和载体    5
1.1.3  酶与化学试剂    6
1.2  方法    6
1.2.1  DNA提取    6
1.2.2  RNA提取    6
1.2.3  RNA反转录    6
1.2.4  胶回收    7
1.2.5  感受态细胞的转化    7
1.2.6  质粒的提取    7
1.2.7  StBZR1序列的扩增    8
1.2.8  马铃薯植株中StBZR1表达分析    9
1.2.9  生物信息学分析    9
2  结果与分析    9
2.1  StBZR1 cDNA全长的扩增    10
2.2  马铃薯植株中StBZR1表达分析结果    12
2.3  生物信息学分析    12
2.3.1  氨基酸序列    12
2.3.2  磷酸化位点预测    12
2.3.3  蛋白定位预测    13
2.3.4  信号肽预测    13
2.3.5  开放阅读框和蛋白质一级结构的预测    13
2.3.6  蛋白质二级结构的预测    14
2.3.7  蛋白质三级结构的预测    14
2.3.8  进化树    15
2.3.9  序列比对及NLS位点和PEST区域    16
3  讨论    18
致谢    19
参考文献:    19
附录1    20
附录2    20 油菜素甾醇信号转录因子StBZR1基因的克隆及在马铃薯块茎形成中的初步功能分析
引 马铃薯是仅次于水稻、小麦和玉米之外的第四大经济作物,它是一种粮菜饲兼用作物,营养丰富,对生产生活都具有重要意义。其块茎作为产品器官和繁殖器官,富含大量的淀粉、胡萝卜素和蛋白质等营养元素,是一种非常重要的食物来源。目前,我国农业部提出要推动马铃薯的主粮化,这意着随着马铃薯在农业与食品领域的地位日益上升,马铃薯作物的相关研究也将越发重要。 油菜素甾醇信号转录因子StBZR1基因的克隆及在马铃薯块茎形成中的初步功能分析:http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_21099.html
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