毕业论文

打赏
当前位置: 毕业论文 > 生物论文 >

赤霉素诱导葡萄胚败育相关基因的克隆序列分析与时空表达特征鉴定(4)

时间:2018-09-18 20:45来源:毕业论文
表2 cDNA的合成体系 Table 2 Synthesis system of cDNA 消化后的RNA Primer Script RT Enzyme Mix I(3) RT Primer Mix(5) 5x Primer Script Buffer2(4) RNase Free H2O(6) 10.0L 1.0uL 1.0uL 4.0uL 4.0uL


表2  cDNA的合成体系
Table 2  Synthesis system of cDNA
消化后的RNA  
Primer Script RT Enzyme Mix I(3)
RT Primer Mix(5)    
5x Primer Script Buffer2(4)
RNase Free H2O(6)    10.0μL  
1.0uL
1.0uL
4.0uL
4.0uL
Total Volume        20.0μL
    ②在PCR仪中,37℃  15min,85℃  5s,4℃  10s;
    ③反转后的cDNA用ddH2O进行稀释,分别稀释到 5倍,10倍;再分别用内参基因Actin标定不同样品的cDNA浓度。
    ④原液置于-40℃ 保存备用,稀释后的cDNA置于4℃ 短期保存。
1.2.2.3  引物设计
    通过基因生物信息学分子中从NCBI下载的目标基因在葡萄中的基因序列,并分析获得其编码区,利用在线软件Primer3.0对编码区序列进行引物设计,并由上海生工生物工程有限公司合成。具体序列见表3。
表3 PCR引物序列
Table 3  PCR Sequence of primers
基因    引物名称    引物序列    退火温度
VvAGL15    VvAGL15-F1    ATGGGACGTGGTAAGATTGAGA    60.0
    VvAGL15-R1    TTTAACTGCCAGAGTTGTTGG    59.7
VvAGL23    VvAGL23-F1    ATGCTTTGTGTAGTGAACATGGGGAG    63.4
    VvAGL23-R1    TTACCCGAGATGGAGGACCTTCTTAT    62.6
VvLEC1    VvLEC1-F1    ATGGAGACTGGAGGCTTCCA    60.3
    VvLEC1-R1    TCATTTGTACTGGGCATATGGTTC    59.1

1.2.2.4  PCR扩增反应
    以上述提取的cDNA为模板,进行目的基因的PCR扩增,具体体系如下表4。
表4 PCR反应体系
Table 4   Reaction system of PCR
试剂    使用量
cDNA    2μl
PCR Forward Primer     1μl
PCR Reverse Primer     1μl
Buffer    2.5μl
dNTP    0.5μl
rRaq    0.2μl
ddH2O    17.8μl
Total    25μl反应程序:94℃, 5min; 94℃, 30S, 60℃, 30S, 72℃, 1min; 35 个循环后 72℃, 10 min;4℃保存。2%浓度琼脂糖凝胶电泳,检测目的条带。
1.2.2.5  PCR产物的回收
    在切胶仪上切下 DNA 目的片段的凝胶块,使用上海捷倍思基因技术有限公司的试剂盒进行PCR产物回收,具体步骤详见产品使用说明。 赤霉素诱导葡萄胚败育相关基因的克隆序列分析与时空表达特征鉴定(4):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_23165.html
------分隔线----------------------------
推荐内容