对水稻分蘖的形态学、组织学都有很多的描述，但是分蘖的分子机制一直没有弄清。经过不懈努力，我国科学家成功分离和克隆了水稻分蘖的主控基因MOC1，该成果是由中国科学院遗传与发育研究所李家洋院士及其合作者在国内独立完成的。MOC1基因控制着腋生分生组织的起始和分蘖芽的形成，同时还有促进分蘖芽伸长的功能[8]。因此，MOC1是水稻分蘖的关键调控基因。MOC1基因编码的蛋白质与番茄Lateral suppressor(LS)同源性高达44%，属于植物特有的GRAS家族蛋白[9]。对这一基因的进一步研究，将有望阐明禾本科作物分蘖调控的分子机制，对于水稻等禾本科高产品种的培育有重要的理论和应用价值。
同源性即进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系[10]。具体来说就是由于进化上或个体发育上的共同来源而呈现的本质上的相似性，但其功能不一定相同，如熊猫的前肢和鸽子的翅膀。从分子水平讲则是指两个核酸分子的核苷酸序列或两个蛋白质分子的氨基酸序列间的相似程度。这也是进行同源性分析的基础。
本次实验需要用到以下几个软件，他们是：
UltraEdit: 是一套功能强大的文本编辑器，可以编辑从NCBI网站上下载的FASTA格式的基因序列和蛋白质序列。
BioEdit: 是一个序列编辑器与分析工具软件。功能包括：序列编辑、RNA分析、寻找特征序列，支持超过20000个序列的多序列文件、具有基本序列处理功能。 水稻分蘖基因MOC1在高等植物中的同源性分析(2):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_24866.html