访问号     Accession no.    编号      ID    性别 Gender    过滤读长 Clean reads    总读长    Total reads    质量值百分比         ≥Q30%    映射读长 Mapped reads    映射效率Mapped  ratio
SRX1176332    GC    male    19,144,607     38,289,214     94.88%    78,690     0.21%
SRX1176334    GC1    male    22,189,389     44,378,778     95.01%    77,905     0.18%
SRX1176335    GX    female    15,748,982     31,497,964     95.11%    60,099     0.19%
SRX1176337    GX1    female    18,458,982     36,917,964     95.25%    72,209     0.20%
SRX159747    L180C    male    25,742,867     51,485,734     89.73%    48,528,056     90.37%
SRX160791    L180X    female    25,129,239     50,258,478     90.25%    41,686,521     82.95%
SRX170662    L30C    female    26,570,168     53,140,336     89.81%    46,261,227     87.05%
SRX170664    L30X    male    26,289,733     52,579,466     90.27%    44,563,037     84.75%

其中GC、GC1、GX、GX1是蓝头濑鱼性腺转录组数据。L180C、L180X、L30C、L30X是尼罗罗非鱼性腺转录组数据。
GC, GC1, GX, GX1 were the blue head wrasses gonad transcriptase data. L180C, L180X, L30C, L30X are Nile tilapia gonad transcriptome data.
2.2两种鱼类转录组表达水平
在基因表达水平上，FPKM≥1的基因数目共有22754个，FPKM≥5的基因数目共有18838个，其中绝大多数来自尼罗罗非鱼性腺转录组（见表3）。
表3 性腺转录组基因数目及表达水平统计表                                                  Table3  Summary of gene counts and FPKM values from gonads
转录组      Transcriptome    基因数目                  gene counts    FPKM≥1的基因数目            FPKM≥1    FPKM≥1的基因数目        FPKM≥5
BM    1,655     224     75
BF    1,804     247     71
NM    24,621     21,658     17,866
NF    25,027     21,009     15,656
总数 Total    25,166     22,754     18,838
            
其中，BM表示蓝头濑鱼雄性性腺转录组，即GC和GC1数据；BF表示蓝头濑鱼雌性性腺转录组，即GX和GX1数据；NM表示尼罗罗非鱼雄性性腺转录组，即L180C和来L30X数据；NF表示尼罗罗非鱼雌性性腺转录组，即L180X和L30C数据（下图同）。 尼罗罗非鱼和蓝头濑鱼的性腺转录组差异表达分析(5):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_25150.html