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裸子植物云杉GDU蛋白异常扩增与进化分析(5)

时间:2019-09-18 12:39来源:毕业论文
PaGDU46 MA_69823g0010 MA_69823:2413-2790 378 1 1(35-57) PaGDU47 MA_70871g0010 MA_70871:4485-4814 330 1 1(20-42) PaGDU48 MA_7105878g0010 MA_7105878:1-432 432 4 1(65-87) PaGDU49 MA_780420g0010 MA_780420


PaGDU46     MA_69823g0010     MA_69823:2413-2790    378    1    1(35-57)
PaGDU47     MA_70871g0010     MA_70871:4485-4814    330    1    1(20-42)
PaGDU48     MA_7105878g0010     MA_7105878:1-432    432    4    1(65-87)
PaGDU49     MA_780420g0010     MA_780420:2575-2961    287    2    1(46-68)
PaGDU50     MA_79500g0010     MA_79500:15622-15969    348    11    1(21-43)
PaGDU51     MA_8538472g0010     MA_8538472:60-410    351    1    1(37-59)
PaGDU52     MA_8817769g0010     MA_8817769:455-742    288    0    1(21-43)
PaGDU53     MA_8869g0010     MA_8869:41381-41731    351    12    1(20-42)
PaGDU54     MA_890390g0010     MA_890390:1471-1848    378    0    1(15-37)
PaGDU55     MA_8983981g0010     MA_8983981:1-1718    1718    1            1(30-52)
PaGDU56     MA_9025515g0010     MA_9025515:893-1246    354    8    1(27-49)
PaGDU57     MA_91090g0010     MA_91090:17920-18198    279    5    1(20-42)
PaGDU58     MA_935479g0010     MA_935479:8916-9239    324    100    1(24-46)
PaGDU59     MA_9356847g0010     MA_9356847:1501-1821    321    6    1(26-48)
PaGDU60     MA_956097g0010     MA_956097:1-1381    1381    4    1(20-42)
PaGDU61     MA_9832g0010     MA_9832:5296-5598    303    3    1(20-42)
PaGDU62     MA_9836g0010     MA_9836:36982-37320    339    23    1(21-43)
PaGDU63     MA_99763g0010     MA_99763:11030-11377    348    4    1(20-42)
2.2 云杉及模式植物GDU家族基因的系统进化关系
为了了解云杉及模式植物GDU家族基因的系统进化关系,选取云杉、拟南芥和水稻等物种GDU家族基因中中的77个的基因。以这77个基因作为对象构建系统进化树[16],如图2。通过对云杉及模式植物GDU家族基因的系统进化分析可以看出,GDU家族基因一共可分为5个类群分别命名为GroupⅠ~Ⅴ,每个类群分别以不同的颜色在进化树中标注[17]。从进化树图中可以看出GroupⅠ类群中包含6个基因,其中有云杉2个基因为PaGDU37和PaGDU27、拟南芥有1个基因AT5G38770、水稻3个基因为Os02g08170、Os02g09850 和Os02g42660[18]。GroupⅡ有18个基因大部分为云杉基因有16个,拟南芥只有一个AT3G30725基因[19]。Group Ⅲ类群有13个基因,云杉有5个基因,水稻有3个基因,拟南芥有5个基因。Group Ⅳ类群有9个基因,全部为云杉基因。Group Ⅴ类群有31个基因和GroupⅣ类群相同也全部为云杉基因。从中我们可以得知,Group Ⅴ类群所含基因数最多为最大类群,其次分别为Group Ⅱ类群、GroupⅢ类群、 Group Ⅳ类群 和Group Ⅰ类群。 裸子植物云杉GDU蛋白异常扩增与进化分析(5):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_39425.html
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