摘要：小桐子的种子含油率高，经加工后可做成生物柴油，其树皮、叶子、根等还可以提取出药原物质做生物医药或生物农药。JcHSP-1是小桐子中编码小分子热休克蛋白的基因，在逆境应激情况下或花粉成熟期、合子的胚胎发生期及种子成熟期都大量表达。本文系统地对JcHSP-1基因进行了生物信息学分析，发现JcHSP-1蛋白分子量为24476.1，具有219个氨基酸，不稳定参数达66.54，为不稳定蛋白。而且，该蛋白与许多其他物种的HSP蛋白都具有高度的相似性和同源性，反应出JcHSP-1基因较为保守。这些信息将为JcHSP-1基因功能的分析奠定理论依据，将有助于培育高产优质的小桐子。43754
毕业论文关键词：小桐子；JcDHN-1；生物信息学
Bioinformatic analysis of the JcHSP-1 gene in Jatropha curcas
Abstract: The oil content in Jatropha curcas seed is high, and the oil can be made into biodiesel. The extract from the barks, leaves and roots of Jatropha can be used for biomedical or biological pesticide medicine. JcHSP-1 belongs to the Heat Shock Proteins (sHSPs) gene family, and it expresses greatly in the case of adversity stress or pollen maturation, zygote embryogenesis and seed maturation. This paper systematically analyzed the bioinformatics data of JcHSP-1 gene. The results showed that molecular weight of JcHSP-1 protein, which consisted of 219 amino acids, was 24476.1, and its unstable parameter was 66.54. Moreover, the HSP protein of Jatropha and many other plant species had high degree of similarity and homology, which reflected that JcHSP-1 gene was relatively conserved. These data would be hepful for the function analysis of JcHSP-1 and molecular breeding of high quality Jatropha cultivars.
Keywords: Jatropha curcas; JcDHN - 1; bioinformatics
目 录
摘 要 1
引言 1
1、小桐子的简介 2
2、研究概况 3
3、研究的目的与意义 4
4、结果与分析 4
4.1小桐子JcHSP-1类蛋白序列挖掘 4
4.2小桐子及其他物种HSP基因家族成员及相关信息 5
4.3小桐子JcHSP-1蛋白质理化性质分析 6
4.4小桐子JcHSP-1蛋白磷酸化位点分析 7
4.5小桐子JcHSP基因家族保守位点分析 8
4.6小桐子JcHSP基因家族的进化发育分析 9
5、讨论与展望 11
参考文献 12
致谢 13
小桐子JcHSP-1基因生物信息学分析引言
小桐子浑身是宝，作为药材，可以消炎、杀死癌细胞及侵入人体的癌细胞等；做为能源物质，可行驶柴油的功能，缓解石油的匮乏；此外，还可用来做油漆、肥皂及农药等。而且其抗旱能力强、耐高温、成活率高、种子出油率高，故使用范围日益广泛，也越来越受到人们的重视，目前世界各国正在对小桐子进行积极的研发和利用。而小桐子的种子在发育与成熟的过程中，其对干燥的耐受力主要依靠晚期胚胎富集蛋白（late embryogenesis abundant，LEA）。除了LEA，另一种类型的蛋白质表达在发育中的种子便是小热休克蛋(sHSPs)，在具有压力的环境中，热休克蛋白是一组非常重要的应激蛋白，有利于生物的生存及促进其损伤恢复[1]。
sHSPs执行为分子伴侣的功能，防止变性蛋白的聚合并协助变性蛋白的重新折叠。sHSPs数量多、种类繁，目前已经发现植物中至少有6种细胞内sHSPs：在细胞核或细胞质中的胞浆I类（-CI）及胞浆Ⅱ类（-CⅡ），在细胞器上的线粒体类（-CP）、叶绿体类(-MT)-优尔`文;论"文'网www.youerw.com、过氧化物类(-Px)等[2]。植物在特定的的发育阶段或受到逆境条件的刺激产sHSPs，大量的研究表明了sHSPs通过分子伴侣机制保护逆境中的细胞 ,在植物逆境忍耐发挥着重要作用[3] 。对小桐子的I类热休克蛋白进行生物学分析, 将有助于我们阐明小桐子抗逆性机理、优化其品种。 小桐子JcHSP-1基因生物信息学分析:http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_44755.html