1.1 实验材料、试剂及仪器 1.1.1甘薯块根 南京92,高抗黑斑病,烟台252,高感黑斑病,由江苏省徐州市农科院提供。分别洗净,切成小块,分装后放入-80℃冻存。 1.1.2主要试剂天根 (Tiangen) 生化科技有限公司生产的多糖多酚植物总 RNA提取试剂盒,普通 DNA 产物纯化试剂盒,琼脂糖凝胶 DNA 回收试剂盒,质粒小提试剂盒与2ⅹTaq PCR Master Mix 等;东洋纺(Toyobo)生物科技有限公司生产的 ReverTra qPCR RT Master Mix;宝生物(TaKaRa)有限公司生产的SYBR Premix Ex Taq(Tli RNaseH Plus);奥博星生物技术有限公司生产的 LB营养琼脂;江莱生物有限公司生产的SOC肉汤;北京索莱宝科技有限公司生产的50ⅹTAE;普洛麦格生物技术有限公司生产的 pGEM-T 载体;BioLabs 生产的 Phusion High-Fidelity PCR MM w/HF Buffer;Biomiga 生产的100bp DNA ladder;上海捷瑞生物技术有限公司合成的引物 02314 与内参 GADPH;生命科学学院植物生理实验室提供的Goldenview, 6ⅹ Loading Buffer, 异丙醇,氯仿, 氨苄青霉素, 无水乙醇, DEPC水,dATP,蒸馏水等。
1.1.3 主要仪器 移液枪(Eppendorf), PCR 仪(型号: DTC, TianLong PCR Thermal Cycler),桌上式洁净工作台(型号:VD-650 型,上海苏净实业有限公司),电子天平(型号:BS 110 S, Sartorious),立式压力蒸汽灭菌锅(型号:LDZX-50KBS),恒温混匀仪(型号:JN110-3,苏州吉米诺生物技术有限公司), 漩涡混匀器(型号:WS-861,太仓市科教器材厂),高速台式冷冻离心机(型号:TGL-18000CR,上海安亭科学仪器厂),电泳仪(型号:DYY-6C,北京市六一仪器厂),电热恒温培养箱(型号:DHP-9052,上海一恒科技有限公司),电热恒温水浴锅(型号:DK-S24,上海一恒科学仪器有限公司),微量紫外分光光度计(型号: NANODROP 2000c,赛默飞世尔科技公司),实时荧光定量 PCR 仪(型号:StepOnePlus,美国应用生物系统公司),全自动凝胶成像仪(型号:240,上海领成有限公司),制冰机等。
1.1.4 培养基以及试剂的配制 含 Amp的 LB 固体培养基:使用 AOBOX 02-137 型,称取32g,加入1L蒸馏水,加热煮沸溶解后 pH 调至7.0 分装,121℃灭菌20 分钟,待冷却至50~55℃时加入氨苄青霉素(Amp)(100μg/mL),倒平板。 LB液体培养基(1L):胰蛋白胨(Tryptone) 10g,酵母提取物(Yeast Extract) 5g,NaCl 10g,pH 7,分装后121℃灭菌20 分钟,冷却后4℃保存,使用时再加入氨苄青霉素(Amp)(100μg/mL)。 SOC培养基:使用江莱生物 SOC 肉汤,每1L蒸馏水中加入31.4g,pH 7,分装,冷却后4℃保存。 IPTG 储液:称取 0.5g IPTG 粉末,加入 2mL 蒸馏水溶解,补加至 2.5mL后过注射型过滤器,-20℃冻存。 X-Gal储液(20mg/mL):0.2g X-Gal, 二甲基甲酰胺(DMF)10mL,无需过滤除菌,-20℃避光冻存。 1ⅹTAE:使用 Solarbio 生产的 50ⅹTAE,每 10mL 中加入 490mL 蒸馏水。 蓝白斑筛选含 Amp 的 LB 固体培养基:每个平板上加入 5μL IPTG 和 40μL X-Gal,涂布,在使用前 1h进行配制。 1.1.5其他材料 大肠杆菌(型号:DH5-α,由生命科学学院植物生理实验室提供),枪头,EP 管,研钵,镊子,药匙等 2 实验方法与步骤 2.1 基因02314的克隆与测序 2.1.1总 RNA提取与检测 由于甘薯块根富含多糖,而多糖可能会抑制 RNA 提取过程中酶的效果【9】,因此使用多糖多酚植物总RNA 提取试剂盒提取RNA, 按照说明书上的方法进行提取,并在提取完成后进行分装,每管5μL,放入-80℃冰箱冻存。1.0%的琼脂糖凝胶电泳检测其完整度, 微量分光光度计测量 RNA含量与纯度, 分装, 每管5μL,放入-80℃冰箱冻存。 甘薯几丁质酶02314基因cDNA的克隆及序列分析(2):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_54610.html