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诱导型酵母TAR克隆系统构建及Syringomycin基因簇克隆(4)

时间:2021-11-17 20:13来源:毕业论文
TAR 克隆使用的受体细胞主要是酿酒酵母细胞,经过多年的改进和发展,目前已经应用 于多个领域,结合一些基因工程操作方法,例如插件和播放的调控模

TAR 克隆使用的受体细胞主要是酿酒酵母细胞,经过多年的改进和发展,目前已经应用 于多个领域,结合一些基因工程操作方法,例如“插件和播放”的调控模式等,可以有效地发 掘酵母基因组中可用于合成新型代谢产物的大片段沉默基因簇[9]。利用 CRISPR/Cas9 等基因 编辑技术,还可以实现在酵母复杂的基因组中复制基因片段和染色体位点,为人类基因库的 建立提供了更好的方式,为基因治疗在诊断,基因置换和动物模型利用方面都提供了更多可 能性[10]。

然而,由于 TAR 克隆过程中需要同时将线性化的 TAR 克隆载体与片段化的基因组 DNA 同时导入酵母细胞中,极大的限制了转化效率。对此,本课题通过优化 TAR 捕捉载体构建及 I-SceI 诱导表达系统,使已经含有 TAR 捕捉载体的酵母细胞在感受态制备过程中诱导载体线 性化,用于直接转化基因组片段,显著提高了克隆效率。

1。3 CRISPR/Cas9 基因组编辑体系

CRISPR/Cas9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated Cas9)系 统是可用于各种复杂基因组编辑的第三代人工核酸内切酶。该技术目前在微生物、小鼠和斑 马鱼,甚至人类细胞的基因组修饰工作中都得到了成功应用,基于其特异性强,编辑效率高文献综述

以及系统构建简单等特点成为目前最热门的基因组编辑工具[14]。

最初的 CRISPR/Cas9 体系是从细菌和古细菌的基因组中发现的,细菌利用这样的体系可 以抵抗外源遗传物质的入侵,例如噬菌体的入侵,外源质粒的转移等。具体的运作机制如图 1。2 所示。

图 1。2  产脓链球菌 CRISPR/Cas9 抵抗外源遗传物质入侵示意图

CRISPR/Cas9 系统将入侵外源遗传物质的 DNA 片段整合到 CRISPR 体系中,然后利用 与之相对应的 CRISPR RNAs(crRNAs)来指导 Cas9 酶蛋白对同源序列进行降解,使细菌获 得免疫性。随着对该系统认识的加深,科学家们发现了该系统在其他宿主中进行基因组编辑 的潜在价值,并认识到 Cas9 效应物核酸酶作为一种以 RNA 为导向的 dsDNA 结合蛋白,能 够对 RNA、DNA 和蛋白都进行定位,这使得 CRISPR/Cas9 系统拥有了巨大的改造潜力。同 时,研究表明,只需将无核酸酶的 Cas9 与蛋白融合后,并使 sgRNA 进行适当表达,该体系 即可靶定任何 dsDNA 序列,在此过程中,RN A 可连接到 sgRNA 的末端使得 Cas9 酶蛋白的 结合不受其影响。由此证明 Cas9 能对几乎所有 dsDNA 序列进行识别和编辑,为人工构建 CRISPR/Cas9 体系提供了方向[15]。

由于 CRISPR/Cas9  体系的 工作原理是 crRNA(CRISPR-derived   RNA)与 tracrRNA

(trans-activating RNA)通过碱基配对结合形成 tracrRNA/crRNA 复合物后,由此复合物引导来*自~优|尔^论:文+网www.youerw.com +QQ752018766*

Cas9 酶蛋白在与 crRNA  配对的序列靶点位置将双链 DNA 剪切开后使该 DNA 失效或对其进行修饰等。因而只需在原有 DNA 的基础上替换掉 20~30 bp 的核苷酸,即设计两对引物, 实现对这两种 RNA 的人工设计,改造形成具有导向作用的 sgRNA (short guide RNA),就 可以引导 CRISPR/Cas9 对 DNA 进行定点切割[15]。

CRISPR/Cas9 系统作为现今基因组编辑工具的研究热点,在基因定点突变、基因片段定 点插入、基因组小片段的缺失等方面都有其应用价值,同时在转录激活与一直,基因组结构 调控,表观遗传标记的调节等领域也发挥着独有的作用,为分子生物学和合成学提供了有效 的工具和体系,未来还会在遗传病治疗和药物开发调控中有更加广泛的应用[14]。

本课题首先利用含有博来霉素抗性基因的 DNA 片段进行方法测试,证明该策略的可行 性,并 进一步 克隆了 假单 胞菌中 的 syringomycin 基 因簇 。为了 提高 验证效 率, 还利用 CRISPR-Cas9 基因编辑体系插入了博来霉素抗性筛选标记,使该体系更加完整高效。 诱导型酵母TAR克隆系统构建及Syringomycin基因簇克隆(4):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_85145.html

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