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（1） 活性污泥法
活性污泥法是以悬浮生长的微生物在好氧条件下对污水中的有机物、氨氮等污染物进行降解的废水生物处理工艺。活性污泥工艺的优点，对性质不同的污水适应能力强，建设费用低。活性污泥工艺的缺点，运行稳定性差，容易造成污泥膨胀和污泥流失，分离效果不理想。浙江省东阳市市属某医院出水pH6.22，SS、COD、BOD、粪大肠菌群数的平均去除率76.05%，90.1%，90.55%和99.97%，各项指标达到了国标一级标准[9]。
（2） 曝气生物滤池
曝气生物滤池，简称BAF，20世纪80年代初产生于欧洲的一种膜生物处理工艺。它充分采用给水处理中过滤技术的经验，将生物接触氧化与过滤结合在一起，不设二沉池，通过反冲洗实现滤池的周期更替。曝气生物滤池拥有占地面积小、投资省、出水水质高、抗冲击负荷能力强、运行灵活方便、易于管理、抗冲击负荷能力强等优点。例如山东大学第二医院污水经格栅去除杂物后,用潜污泵抽至斜板沉淀池,同时加入去磷剂,出水自流进入曝气生物滤池,DO控制在3～5mg/L,出水进入清水池后再进入消毒池,二氧化氯加入量为30g/M3废水,停留时间1.5h。曝气生物滤池12～24小时进行反冲洗一次,反冲洗出水再返回调节池、斜板沉淀池每天排泥一次,排入污泥沉淀池,其上清液进入调节池,剩余污泥定期消毒后环卫清污车运走。经处理后水质达到(GB8978-1996)一级排放标准[10]。
(2) 厌氧生物处理
废水厌氧生物处理是指在无分子氧条件下通过厌氧微生物（包括兼氧微生物）的作[9]，将废水的各种复杂有机物分解转化成甲烷和二氧化碳等物质的过程，也称为厌氧消化。厌氧生物处理可节省能源；容积负荷高；氮磷需量低；剩余污泥量少；有杀菌作用；污泥存期长；应用范围广；水温适应广。但是厌氧微生物增殖缓慢，因此其启动及处理需要较长时间；厌氧法出水往往达不到标准，一般须在其后串联好氧处理设备；厌氧法运行控制因素较为复杂和严格，对污水中含有毒有害物质较敏感。一般医院废水多采用水解酸化。
水解酸化法的作用原理为：利用水解和产酸微生物，将污水中的固体、大分子和不易生物降解的微生物降解为易于微生物降解的小分子有机物。废水通过水解酸化池后的去除率可达40％，SS可直接降到50mg/L左右[[11]。
(3) 联合处理工艺
(a) 水解酸化生物接触氧化工艺
水解酸化池由兼性菌在缺氧或厌氧条件下进行水解和酸化阶段，控制溶解氧小于0.2mg／L，停留时间1h，填料给微生物提供了载体，让污水与生物膜大面积接触，将污水中难降解的大分子转化为小分子有机物，不溶性变成溶解性的有机物，提高污水的可生化性，并去除一部分COD和SS，最重要的是兼性水解还可抑制丝状菌的繁殖。南昌市第九医院经过半年多的实际运行表明，该工艺在进水生化需氧量(BOD，)150mg／L、化学需氧量(COD。)300mg／L、固体悬浮物(ss)300mg／L、pH值6～9、粪大肠菌群50000个几的条件下，污水经处理后，水质达到GB8978—1996《污水综合排放标准》表4中二级标准[12]。浙江省东阳市市属某医院采用了前置水解酸化一生物接触氧化一消毒工艺处理综合医院污水,监测结果表明,出水水质稳定,各项污染物指标均达到了《污水综合排放标准》(GB8978一96)的一级标准,自动化程度高,操作管理简便[13]。
1.6.3消毒处理
医院污水含大量病原微生物,如不经处理而排入地面水域时,往往会造成水体的严重污染,引起各种水介传染病。医院污水处理的消毒处理是整个工艺的最后阶段。其目的是去除废水中的致病菌体和粪大肠菌群。消毒设施主要由消毒剂制备、投加控制系统与混合池、接触池组成。通常使用的消毒剂有液氯、次氯酸钠、漂白粉、二氧化氯等化学消毒剂,也有少数医院污水使用臭氧、紫外线或其他消毒剂消毒。