2。2。2位点选择
ADCY3基因的遗传变异资料从Hapmap数据库(http://hapmap。ncbi。nlm。nih。gov/)中获得,采用Haploview软件的Tagger功能,依据中国人群中的最小等位基因频率>5%,并且与区段内其他SNP的连锁不平衡系数均>0。8的原则,筛选Tag SNP。本研究最终获得12个Tag SNP,见表1。
2。2。3实验室检测
由上海捷瑞生物工程有限公司的专业技术人员采用酚-氯仿法进行DNA抽提,采用连接酶检测反应技术(ligase detection reaction,LDR)进行SNP分型检测,实验采用到的引物和探针序列详见表1。
2。2。4实验过程
(1)PCR扩增:采用东胜EDC-810PCR仪,扩增体系包括DNA样本1 μl,10×PCR缓冲液1。5 μl ,25 mmol/LMgCl2 1。5 μl,10 mmol/L脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)0。3 μl,10 mmol/LPCR引物每条0。15 μl,5 U/μl Tap酶0。3 μl,加ddH2O至15 μl 。扩增条件为94 ℃变性3 min,94 ℃ 15 s,55 ℃ 15 s,72 ℃ 30 s,循环35次,72 ℃退火延伸3 min。(2)测序反应:采用东胜EDC-810PCR仪进行连接反应,反应体系包括PCR产物3 μl,加10×Tap DNA连接酶缓冲液1 μl,Tap DNA 连接酶5 U,10 pmol/L探针每条0。01 μl,加ddH2O至10 μl。条件为94 ℃ 30 s,56 ℃ 3 min,循环30次。连接反应结束后,取1 μl连接产物,8 μl上样缓冲液,95 ℃ 变性3 min,立即冰水浴,最后上ABI3730XL测序仪测序。论文网
2。3统计学分析
应用Epidata 3。1软件进行数据录入与核查纠错,采用SPSS 20。0软件进行统计分析。(1)描述性分析:对年龄等符合正态分布的连续型变量采用均数±标准差(mean±SD)进行描述,对血压、血脂指标、体重指数等非正态分布连续型变量采用M(Q1,Q3)进行描述,对职业等分类变量采用频数和构成比进行描述。(2)单因素分析:满足正态分布的连续型变量采用t检验,不满足正态分布的连续型变量采用非参数检验,对分类资料采用χ2检验;采用Peason χ2检验比较各位点基因型在对照组中的分布是否满足Hardy-Weinberg平衡定律。(3)采用Logistic回归分析ADCY3基因及饮食因素与脂肪肝的关系,计算调整了年龄、性别等因素后的OR值及其95%CI。以P<0。05为差异有统计学意义