摘要：近年来，肿瘤代谢逐渐成为国际上肿瘤研究的热点和中心。因此新型的干靶向PDK抑制剂的发现在抗肿瘤药物研究领域引起人们大量的关注，并在肥胖，糖尿病，心力衰竭和癌症中有上调作用。此课题将3D定量结构活性关系（3D-QSAR）用于探索28个新型的丙酮酸脱氢酶激酶（PDK）抑制剂的结构与活性的影响，建立了配体合成的比较分子场分析（COMFA）和分子相似性指数分析（COMSIA）模型，并展现出良好的可预测性（COMFA的R2为0。917；q2为0。507；F为93。422；COMSIA的R2为0。945；q2为0。531；F为147。281）。三维等高线图的结果显示了化合物的核心部分的不同群组可能提高其生物活性。通过BIOPOLYMER模块准备大分子蛋白，并且修补其所缺失的氨基酸残基。因此，通过对PDK抑制剂以及药物靶标酶的分子对接及其3D-QSAR的研究，有助于我们深入了解药物分子和PDK的结合作用机理，进而设计新的药物分子。80866

毕业论文关键词:  3D-QSAR；PDK抑制剂；COMSIA；COMFA；丙酮酸脱氢酶激

3D - QSAR Model Study of Hepatic Targeted PDK Inhibitors

Abstract: In recent years, tumor metabolism has gradually become the focus of international cancer research and center。 Therefore, the discovery of novel dry targeting PDK inhibitors has attracted a lot of attention in the field of anti-tumor drug research and has an up-regulation in obesity, diabetes, heart failure and cancer。 (3D-QSAR) was used to explore the effect of structure and activity of 28 novel pyruvate dehydrogenase kinase (PDK) inhibitors, and a ligand synthesis comparative molecular field analysis (COMFA) was established。 And molecular similarity index analysis (COMSIA) model, and showed good predictability (COMFA R² was 0。917; q² was 0。507; F was 93。422; COMSIA R²was 0。945; q²was 0。531; F was 147。281)。 The macromolecule protein is prepared by the BIOPOLYMER module and the amino acid residues thereof are deleted。Therefore, through the PDK inhibitors and drug targeting enzyme molecular docking and its 3D-QSAR research, help us to understand the drug molecules and PDK binding mechanism, and then the design of new drug molecules。

Keywords: 3D-QSAR; PDK inhibitor; COMSIA; COMFA ；Pyruvate Dehydrogenase Kinase

目录

1 前言。。。。 1

1。1 肿瘤 1

1。1。1 什么是肿瘤 1

1。1。2 肿瘤与癌症 1

1。2 肿瘤代谢抑制剂的研究现状 1

1。3 计算机辅助设计 3

1。4 3D-QSAR模型 4

2 数据的来源和方法 5

2。1 数据库的叠合 5

2。1。1 化合物的选取 5

2。1。2 骨架的选取 9

2。2 3D-QSAR模型的计算 12

3 结果分析 14

3。1 CoMFA和CoMSIA的统计结果 14

3。2 3D-QSAR等高线图及其结果分析 16

3。3 蛋白准备及分子对接 19

4 总结 21

致谢 22

参考文献 23

1 前言

1。1 肿瘤

1。1。1 什么是肿瘤

肿瘤在当今的社会已经成为了一种是常见病，多发病。肿瘤区分为两类，一种是良性肿瘤，而另一类为恶性肿瘤。其中的恶性肿瘤目前已经成为危害人类健康最严重的一类疾病。同样，恶性肿瘤也被区分为两种类型，一类称为实体瘤，而另一类是白血病。