到目前为止，食品供应链管理的研究已经经历了如下的三个阶段:第一阶段是业务流程管理阶段第二阶段是综合物流管理的阶段。强调生产应以整个物流链的市场需求和成本控制为指导。第三阶段为供应链一体化管理阶段,其研究的范畴不仅仅局限在自身企业，而是扩大到了最上游的企业，从而能够从自身、制造商甚至是供应商上寻找相关问题，帮助企业从多角度进行问题的挖掘与解决[3]。
许多公司供应链系统中，从采购、销售、物流及内部管理系统都存在许多问题在采购上公司容易出现出现的牛尾效应；产品利润空间微薄，完全依赖规模效应；合约的把控制力差，沟通不够紧密。在销售上，产品信息发布不及时，容易出现缺货现象，销售机制不够灵活，造成区域销售差异大。在物流上，仓储利用率低；进出库存在货损货差现象；到货不及时且运费价格偏高。在内部管理上，领导层管理意识不强，严重缺少系统的管理方法；中层干部岗位缺少或职能缺失；信息化程度低。
食品行业与其他行业最大的不同在于商品的运输及保存上。许多食品行业在物流供应链上暴露出了许多问题：物流供应链管理的方法滞后。大部分公司仍然使用传统的管理方式。这导致了诸如相互促进，交叉权力和其他问题等问题。物流设备已过时，更新速度慢。我们的企业物流设备仍旧采用旧设备，设备陈旧，功能单一，远不能满足人们的需求。物流供应链中还存在许多的不确定性，企业物流供应链不仅仅是企业自身的问题[4]。从原材料供应商到产品生产商，再到产品使用者，这些人员之间存在不确定因素，而这么多因素导致了整个物流供应链的不确定性。虽然这些不确定性是不可避免的，但对公司物流管理非常不利，加大了物流管理风险，不利于整个公司的管理。
面对这些问题企业应当转变观念，创新管理方法、转变企业发展战略以人民为核心、提升供应链的信息化程度、加大人才建设力度，提高科学性。企业必须把物流供应链放在企业发展的战略地位，加大重视程度，加强企业管理，同时加大对人才发展的重视程度。不断完善并提高公司基础设施，从而增强公司竞争实力。
2、发展趋势
食品行业的供应链应当建立高效、稳健、敏捷、柔性的供应链网络渠道、增加对采购资源的控制和调配力度，增加对销售渠道和最终客户的掌控力度。更加了解客户，从客户手中得到第一手信息，从而知道供应链那个环节出现问题，有针对性的进行解决。
从“纵向一体化”向“横向一体化”发展，许多企业把非核心业务外包或者把采购、生产、仓储、销售等某些环节业务外包，专注核心业务、设计、品牌的经营，要求协同运营高效、柔性、敏捷。公司通过电子商务的方法来拓展供应链，加强了采购与销售业务之间的电子信息管理，从而提高了企业的竞争力[5]。最后，物联网或许将成为第三次对工业发展模式产生巨大影响的主要载体。
中国企业目前普遍采用的冷链物流模式是“泡沫箱+冷袋模式”。使用“泡沫箱+冷袋”将新鲜产品包装成包装时，包装内部形成适合保鲜产品的局部空间。包裹在物流作业时视为普通包裹，并采用现有的常温物流配送系统。这种模式的成本虽然比较低，但是产品的新鲜程度却难以得到保障。
现今，有一种服务模式来满足新鲜食品的运输，即前置仓模式。前置仓是小型仓库单位，与消费者更接近，通常位于消费者集中的社区附近。其运营模式是:新鲜农产品销售方使用冷链物流（冷藏车）将产品提前交付给商店进行预售。客户下订单后，由前仓库运营商组织进行包裹、生产和“最后一公里”的送货上门。从目前中国市场的具体情况来看，这种冷链物流服务模式较好。无论是订单响应速度还是分销成本，前置仓模式都比直配的优势更大。“分段运输，后备优先，分级和组装，减少扩散”在城际物流，城市快递，以及最后配送过程中，最大限度地降低所有步骤的成本，从而降低总成本，这必然成为一种发展趋势。在成本持续降低的压力下，新鲜配送行业将不可避免地从原来的直接配送转变为垂直分段运输。 食品供应链管理研究现状和发展趋势:http://www.youerw.com/yanjiu/lunwen_204847.html