2.3　比较分子场分析方法——COMFA    13
2.4　比较分子相似性指数分析与假想活性位点阵方法—COMSIA    14
2.5 药效团模型    14
第三章 3D-QSAR模型结果分析    15
3.1 研究对象    15
3.2分子叠合    19
3.3 PLS分析结果    20
3.4 CoMFA模型的预测    21
3.5 CoMSIA模型的预测    22
3.6测试集化合物的预测    23
3.6.1测试集化合物的CoMFA预测结果    24
3.6.2测试集化合物的CoMSIA预测结果    25
3.7 CoMFA等势图    26
3.8 CoMSIA等势图    27
3.9新分子的设计    29
3.9.1新分子设计及对接结果    29
3.9.2对接表面的添加    33
3.10 药效团分析    35
第4章结论    36
致谢    38
参考文献    39
靶向于流感病毒神经氨酸酶新位点的抑制剂设计
第一章
1.1研究背景与目的
流感是由流感病毒引起的一种严重危害人类健康的急性病毒性呼吸道传染病，通过空气传播。
神经氨酸酶（又称唾液酸酶）是一种流感病毒表面蘑菇状的糖蛋白。神经氨酸酶是一种四聚体，由4个相同的亚基组成。每个亚基都是由一个6 叶片螺旋桨状的结构组成，而每个“叶片”又是由4个反平行的β折叠片层组成。酶的活性中心位于每个亚基中央的一个较深的口袋内。
神经氨酸酶是一种糖苷水解酶，在流感病毒的生命周期中，扮演着非常重要的角色。首先，通过水解其底物唾液酸（SA）与细胞表面糖蛋白之间的糖苷键，神经氨酸酶促进了病毒在上呼吸道的传播和新生成的子代病毒从宿主细胞表面的释放，进而感染新的细胞。其次，神经氨酸酶还可以通过清除掉新装配的病毒表面的唾液酸残基，从而防止病毒之间因血凝素和唾液酸之间的相互作用而引发聚集。
18个保守的氨基酸残基组成了神经氨酸酶的活性中心，其中8个高度保守的氨基酸残基直接与底物发生作用，参与其催化过程。而剩下的氨基酸残基则具有文持酶活性中心空间构象的作用。2003年，Stoll等[1]建立了神经氨酸酶活性中心与抑制剂的结合模型（图1），根据该模型，神经氨酸酶的活性中心可以分为5个结合区域 靶向于流感病毒神经氨酸酶新位点的抑制剂设计(2):http://www.youerw.com/yixue/lunwen_27046.html