一是审计部门缺乏合作意识。审计人员只关注本部门的利益，对其他部门显示出“事不关己”的态度。由于缺乏有效沟通，极易造成职能孤立的局面，各部门之间合作较为困难。以大型的审计项目为例：项目负责人虽具有相对的决策权，负责调度整个项目，对整个项目的资源和人员调度难度较大，而各个项目小组只趋向于完成本组的任务，这样一来，项目的整体目标不能很好地实现。二是审计项目呈现多元化、大型化的发展趋势。随着审计项目内外部环境的变化，审计项目和被审计对象日益复杂化和大型化，例如政府审计涉及多个业务部门，包括财政审计，财经法规审计，经济效益审计，农业审计，管理审计等；国有企业审计作为经济责任审计的中心，对地方经济的发展作用巨大。国有企业涉及各个行业和领域，包括基础设施投资，公共卫生事业投资，高新技术产业投资等，涉及金额巨大，业务量大，组织结构复杂，因此审计组织通常由几个不同地点，不同领域的，分散的审计小组组成。审计项目组长作为项目负责人，需要将分开的各组审计成员汇集在一起，从而形成一个高效率的团队，以保证项目的实施。而复杂的审计项目需要多个部门协调合作，但不同审计部门和审计环节间合作的存在不理解，不配合，沟通不顺畅的问题，因此不符合一个复杂的项目审计发展的要求，不利于审计项目的开展。