诺如病毒GⅠ、GII型流行株基因组特征分析及进化机制研究(3)
时间:2018-05-10 20:49 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
1.3 诺如病毒感染案例的特征 综合上述多起由诺如病毒感染而引起的急性胃肠道疾病的案例，得出诺如病毒的特点如下，该病毒不仅在中国多个城市及地区存在暴发案例，还在美洲、欧洲等多个国家及地区存在暴发案例，暴发案例遍及全球，说明诺如病毒传染范围极广；在多起案例中发病患者数量成百上千，在前文所述的德国首都柏林由于食用冷冻草莓而导致的急性肠胃炎小学生和托儿所的幼儿患者数竟然高达1万多，说明若如病毒具有高度感染性；发病患者多，也从侧面说明了若如病毒具有治病剂量低的特点；虽然在上述多起案例中诺如病毒暴发引起的症状都是急性胃肠炎，但其传播的媒介却各不相同，在广州的案例中诺如病毒通过水作为媒介进行传播，在美国的案例中诺如病毒通过色拉、冷盘、绿叶蔬菜、牡蛎等可生冷食用的食物与食品作为其传播媒介。在德国的案例中，诺如病毒以冰冻的草莓作为其传播媒介，竟然感染了1万多人，由此可见诺如病毒的传播媒介广以及其抵抗外界不理想条件的能力极其强大。 诺如病毒具有传播范围广、感染性程度高、致病剂量低、传播媒介多样以及抵抗外界不理想条件能力强等特点，因此受到了许多国家的重点关注。中国、美国、日本以及欧洲国家都致力于研究抗诺如病毒的药物以及疫苗，但成果都乏善可陈。 1.4 诺如病毒的基因组 诺如病毒属于单股正链RNA病毒，基因组全长约7．7kb，包括5’端非编码区、3个开放阅读框(ORF1、ORF2和 ORF3)、3’端非编码区以及poly A区，ORF1编码包括保守的具有RNA多聚酶(RNA dependentRNA polymerase，RdRp)在内的非结构蛋白，ORF2编码相对分子质量约为56kD的VP1衣壳蛋白，ORF3编码一种相对分子质量约为22.5kD的强碱性微小结构蛋白。VP1蛋白被认为与宿主受体识别有关，包括壳区(Shell，S)和突出(protruding，P)，S区形成内壳，P区形成拱样结构突出于内壳外，P区进一步分为P1和P2亚区，后者是受体结合的关键区域。也有学者提出观点认为，P2氨基酸的变异使病毒具有再感染个体的能力，从而逃避人群免疫性[7]。 1.5 诺如病毒的遗传多样性 诺如病毒具有丰富的基因多样性。基因组中的RNA聚合酶区序列相对保守，而衣壳蛋白位于病毒的最外部，是基因组中变异频率最高的区域之一，病毒借助不断突变以逃避宿主免疫或改变自身的受结合方式，适应环境压力变化，从而增加病毒的稳定性。依据诺如病毒基因组的RdRp和衣壳蛋白编码区的核苷酸序列差异，诺如病毒基因分为5个基因组别GI～GV。同一基因组内不同病毒株的核苷酸序列同源性为69%-97%，而不同基因组的病毒株只有51%-56%[8]。GI、GII和GIV型为人源病毒，GII型中还包括猪源诺如病毒，GIII型可感染羊和奶牛，GIV型感染人、狗和狮子，GV型为鼠源病毒，最近新出现的GVI型病毒可以感染人和狗。目前还没有从人类中分离到动物源病毒，但从动物中已经检出人源诺如病毒，例如从羊粪中分离的到的GII型病毒和人源诺如病毒同源性很高，并且人源GII.4型诺如病毒可以感染猪和牛。 每个诺如病毒基因组还可进一步分为不同的基因型，目前GI包括9个亚型，GII包括19个亚型，GII型与GIV型各含两个，GV型只有1个[9]。根据序列相似性，同一基因型又可进一步分离成不同的基因簇，同一基因簇内病毒的衣壳蛋白相似性很大，例如GII型诺如病毒不同簇之间核苷酸变异率仅2%左右。 1.6 诺如病毒的进化 诺如病毒在出现后的近三十年里未造成大规模的暴发，上世纪70年代就已经有关于GII.4型诺如病毒的报道，但至90年代中期才首次确认GII.4为在世界范围内传播的主要流行株，并且至今GII.4型一直是各地流行诺如病毒的主要基因型，而且每隔两三年就会产生新变异株，至今已至少造成四次全球规模的暴发。 (责任编辑：qin) |