欧洲大麦品种SSR指纹图谱的构建(3)
时间:2023-06-13 22:27 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
PCR扩增:10μL的反应体系(如表1),即提取好2μL DNA,2μL SSR引物,再加6μLMix(Mix:ddH2O=5:1)后放入PCR仪扩增(PCR扩增程序(如表2):94℃预变性 5min; 94℃35s,55℃30s,72℃40s(38个循环); 72℃延伸10min)产物放置4℃保存。 试剂 体积 DNA 2μL SSR引物 2μL 5μLMix 5μL ddH2O 1μL 表1 10μL的扩增反应体系 步骤 温度 时间 Step1 94℃ 5min Step2 94℃ 35s Step3 55℃ 30s Step4 72℃ 40s(38个循环) Step5 72℃ 延伸10min 表2 PCR扩增程序 1、2、2 扩增产物电泳及检测 扩增产物在 2% 的聚丙烯酰胺凝胶上进行分离,(称取8g琼脂糖,再加入400mL电泳液(TBE:H2O1:10)中),电压 130 V/cm,经染色(核酸染料)、显影后,拍摄SSR 谱带照片备存和数据分析。 1、3 SSR引物的筛选文献综述 采用SSR标记技术,根据所选的欧洲大麦的样品进行对引物的筛选,获得具有高度多态性的引物。 1、4 数据统计和统计方法 使用Excel软件记录51份大麦品系的SSR谱带照片中的DNA条带大小值。利用28对的引物构建大麦指纹图谱,记录扩增条带,用“1”和“0”分别来表示同一位置扩增片段的有或无。 参考薛华柏等[7]的方法来构建SSR 特征指纹数据表。利用筛选到的SSR引物对欧洲地区大麦品种进行指纹图谱的构建[8-10]。 1、5 数据分析 根据指纹图谱来分析大麦的遗传机制[11-12]。 2、结果与分析 2、1 SSR多态性分析 通过筛选,从多对引物中筛选到28对多态性好的引物(如表3所示),可在实验中得到多个多态性片段 (责任编辑:qin) |