孟加拉眼镜蛇毒腺转录组分析
时间:2023-10-01 22:23 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
摘 要 毒液是动物适应环境的一大进化创新,在动物的生存中发挥至关重要的作用。作为重要的功能生物大分子资源库,一直以来,蛇毒受到学术界及产业界的高度关注,很多重要且高效的药物及抑制剂来源于蛇毒组分。随着测序技术的发展,二代测序技术无论从信息量还是种类上,都为蛇毒转录组层面的多样性研究提供了极大的便利。本课题以国产孟加拉眼镜蛇(Naja kaouthia)成体为研究对象,利用高通量测序技术分析其毒腺转录组构成特征,推断毒液中存在的潜在表达多肽序列,并与实验室已有的关于该种毒蛇蛇毒蛋白组研究结构进行比较,探讨转录组水平蛇毒构成的多样性和复杂程度,为毒素基因进化和功能研究、新基因的发现和利用提供一定的线索。85182 毕业论文关键词:孟加拉眼镜蛇;毒腺;cDNA文库;转录组学; Objective: Venom, as one of the most important innovations for animals to adapt to the environment, plays an important role in the survival of animals。 As an important functional biological macromolecules resource literature, the snake venom has been highly concerned by academia and industry, and many important and effective drugs and inhibitors are derived from snake venom components。 With the development of sequencing technology, the second generation sequencing technology brings much convenience to the study of the transcriptome-level persity。 The research takes Naja kaouthia as the experiment object, using high-throughput sequencing technology to analyze the venom gland transcriptome constitutive characteristic, deducing the potential expression of polypeptide sequence existed in venom and comparing with the known venom protein structure in the laboratory, then exploring the persity and complexity of transcriptome of snake venom, providing some new clues for gene toxin evolution, function research, discovery and utilization。 源Q于W优H尔J论K文M网WwW.youeRw.com 原文+QQ75201.,8766 Keyword: Naja kaouthia; venom gland; cDNA library; EST 目 录 摘 要 2 1。引言 4 2。材料与方法 5 2。1。材料 5 2。2。毒腺总RNA的提取 5 2。3。毒腺cDNA的合成来自优W尔Y论W文C网WWw.YoueRw.com 加QQ7520,18766 与测序 5 2。4。转录组的组装,注释和量化 5 3。结果与讨论 6 3。1。毒腺转录组分的构成 6 3。2 蛋白组学与转录组学的比较 7 参考文献 8 致谢 11 1。引言 新蛇类毒液的进化使得它们在捕食上从机械方式(收缩)过度到化学(毒液),并在所涉及的蛇的多样化中发挥了重要的作用[1]。蛇毒的变异性是由新毒素基因的募集或是原先存在的毒素基因的爆炸性多样化引起的,这些毒素基因出现于新蛇类进化过程之前和进化过程之中[2,3]。我们推测,毒素快速进化的巨大驱动力是自然选择[4,5]。一般来说,功能角色的复杂性与毒液组成和丰度的变异性高度相关[6-9],从而阐明了蛇毒液和毒腺转录组学将有助于毒蛇咬伤的临床管理,药用成分和抗蛇毒血清的制备。论文网 中国毒蛇大约有60种,其中在乡村被毒蛇咬伤所引起的毒性作用非常严重[10,11]。在这里,我们研究了广泛分布在印度东北部,孟加拉国,马来西亚,印度支那半岛,尼泊尔和西南(云南,四川和广西省)的临床重要眼镜蛇——孟加拉眼镜蛇(Naja kaouthia)[12]。孟加拉眼镜蛇的毒性作用能诱发几种非常严重的症状,包括上睑下垂,吞咽困难,唾液分泌增多,甚至导致昏迷和呼吸麻痹死亡[13-15]。最近一项关于孟加拉眼镜蛇毒液的蛋白质组学特征和潜在作用的研究发现了来自粗毒液的12个蛋白质家族,其中3-FTx和PIA2是主要成分,分别占总毒液的77。5%和13。5% [16]。相似的蛋白质组图在来自马来西亚,泰国,越南的孟加拉眼镜蛇中也有鉴定出,虽然毒液组成和丰度有明显的地理差异,可能与毒液致死率的差异有关[17]。然而,由于孟加拉眼镜蛇的毒液转录组谱还未被研究,我们仍然不能更深入地了解毒液蛋白质组学特征。 (责任编辑:qin) |