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2 内容与方法

2。1 数据来源

本实验主要通过查阅国际生物技术信息数据库（NCBI）（https://www。ncbi。nlm。nih。gov/）中的Gene Expression Omnibus（GEO）板块（http://www。ncbi。nlm。nih。gov/geo/）对目前小麦转录组数据进行统计分析（图1，图2）。

图1 国际生物技术信息数据库（NCBI）

图2 国际生物技术信息数据库（NCBI）中Gene Expression Omnibus（GEO）板块

2。2 查询过程文献综述

目前，关于小麦种子转录组芯片数据共包含1个平台下的2个实验数据和37个样品信息。GEO（http://www。ncbi。nlm。nih。gov/geo/）的数据存储可以分为四个层面，分别为GPL-Platform、GSE-Series、GSM-Sample和GDS-Dataset，其中GPL-Platform描述实验平台的信息，对芯片平台而言，描述芯片类型及芯片上的探针数据等信息；GSE-Series包含一系列的样本（GSM），据此可以得知多个相关样本的所有基因的表达量等信息；GSM-Sample描述单个芯片实验的杂交数据，据此可知特定样本与芯片杂交之后测得的mRNA表达量或SNP等位基因型等信息；GDS-Dataset由GEO 职员根据GSM编纂组合起来的条目，与 GSE 类似，同样描述了多个相关样本的所有基因的表达量等信息[9]，如在NCBI网站上公布的小麦芯片平台编号GPL3802，通过该编号可以在已有数据库NCBI的GEO板块中找到该芯片的具体信息