以人组织为模型分析microRNA表达量与转录的相关性
时间:2018-07-26 19:59 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
| 摘要：本次研究以人组织为研究对象，骜合生物信息学和生物统计学技术与方法，研究在基因组水平上调控动物microRNA表达的机制。研究使用了优尔十二组来源于人组织(human tissue)这一模式生物的测序数据，以揭示调控机制的保守性及重要性。利用microRNA/pri-microRNA与人类基因组信息的重叠序列，将相对应的microRNA-seq和mRNA-seq连接，从而得到其表达量的相关性。以microRNA信息分析得出转录过程对microRNA表达没有影响，且以pri-microRNA信息分析得出的结果不具备可信度。综合以上得出结论：在人组织中，转录过程对microRNA差异性表达没有明确的相关性，此结论为以后的相关研究提供了一定的参考价值。26196 毕业论文关键词：microRNA；mRNA；生物信息学；表达量 The correlation between microRNA expression and transcription was analyzed by human tissue Abstract：The study looked at the mechanism by which human tissue was used to regulate the expression of microRNA at the genome level, by using bioinformatics and biometrics。The study used sixty-two groups of data from human tissue model to reveal the conservatism and importance of regulatory mechanisms。Using the overlapping sequence of microRNA/ pri-microRNA and human genome information, the corresponding microRNA-seq and mRNA-seq were matched to obtain the correlation of their expression quantity。 MicroRNA information analysis showed that the transcription process had no effect on the expression of microRNA,and The results obtained by pri-microRNA information analysis do not have credibility。 Draw the conclusion above that there is no clear correlation between the transcriptional process and microRNA differential expression in human tissue。 This conclusion provides a reference value for future related study。 Key words: microRNA；mRNA；Bioinformatics；expression quantity 目 录 摘要1 关键词1 Abstract1 Key words1 引言1 1 材料与方法3 1。1 材料：研究中实验数据的来源 3 1。2 研究内容 3 1。3 研究方法3 1。4 技术路线3 1。5 实验方案4 2 结果与分析5 2。1 基于人组织所获取的原始数据结果汇总5 2。1。1 根据人组织成熟microRNA信息分析mRNA转录与microRNA表达量的相关性分析结果5 2。1。2 根据人组织pri-microRNA信息分析mRNA转录与microRNA表达量的相关性分析结果 6 2。2 基于人组织成熟microRNA信息和pri-microRNA信息分析mRNA转录与microRNA表达量的相关性结果分析7 3 讨论8 致谢8 参考文献9 以人组织为模型分析microRNA表达量与转录的相关性 microRNA是近年来发现的与基因表达调控相关的一类非编码小分子单链RNA，长度约21-23个碱基对构成，通过与靶mRNA碱基对特异结合，引起靶mRNA降解或翻译抑制，调控基因转录后的表达[1]。目前人类microRNA数据库中已有721个之多，大约占人类基因总数的2-3%，约调控30%的编码蛋白基因，每个microRNA约调控100个靶mRNA[2]。microRNA调控各种各样的生理过程；microRNA表达量的高低、变化可以反映生物个体、组织、细胞的表型，此信息还可能用于人类疾病(如癌症)的诊断、预后及治疗[3-6]。 (1) microRNA的产生机制 典型(canonical)动物miRNA的形成要经过转录及一系列特异性的RNA加工和RNA:蛋白相互作用[7,8]。miRNA基因通常由RNA聚合酶II（PolII)转录，最初产物为pri-miRNA (primary miRNA)，和pre-mRNA相似。细胞核内的Drosha/DGCR8全酶识别并切割pri-miRNA上特定的发卡结构，产生约60 nt 的pre-miRNA (precursor miRNA)。转运蛋白Exp5把pre-miRNA送到细胞质中。然后,RNA酶Dicer切割pre-miRNA，产生约22 nt的miRNA双链中间物。此双链RNA与Argonaute (Ago)蛋白作用，最终其中一条单链RNA，作为成熟的miRNA，与Ago蛋白稳定结合。这一miRNA:Ago复合体即是抑制基因表达的最小功能单位。据miRBase的统计整理，动物基因组有成百上千个miRNA基因[9]。虽然相当数量的这些基因是否表 达真正的miRNAs仍然存疑，但确知的是，一个Drosha蛋白(同理，Pol2、 Exp5、 Dicer和Ago)直接作用于数以百计不同的miRNA底物。 (责任编辑：qin) |