高RA甜叶菊辅助选择育种EST-SSR分子标记开发
时间:2018-07-26 21:14 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
| 摘要：本实验以甜叶菊转录组数据为基础，基于EST-SSR分子标记为手段，通过分析甜叶菊EST-SSR与甜叶菊RA含量之间的关系，设计了85对EST-SSR引物，所得的PCR产物分别用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺胶进行分离，通过PAGE对23个甜叶菊个体总体分析，其多态位点为31，多态性比率为71.7%。基于遗传相似系数的UPGMA聚类分析将甜叶菊的三个大类群明显聚为 2支，将23个材料聚类为5大支。在筛选出的31号引物中，在180bp的位置上，4种高RA的甜叶菊所得的扩增片段与其他甜叶菊相比缺失一条带，因此，31号引物有望成为筛选高RA甜叶菊材料的EST-SSR引物。 毕业论文关键词：甜叶菊；EST-SSR分子标记；遗传多样性；RA；育种26229 Development of EST - SSR Molecular Marker for Selection of High RA Stevia Abstract： Based on the EST-SSR molecular marker, the relationship between EST-SSR and the content of RA in stevia was studied. 85 EST-SSR primers were designed and the PCR products the polymorphism was 31, and the polymorphism ratio was 71.7%. The polymorphism of 31 stevia leaves was analyzed by PAGE with agarose gel and polyacrylamide gel. UPGMA cluster analysis based on genetic similarity coefficient showed that the three major groups of Stevia were clustered into two groups, and 23 materials were clustered into 5 major branches. In the selected 31 primers, the amplified fragments of four high RA stevia leaves were absent compared with other stevia leaves at the position of 180bp. Therefore, primers 31 were expected to be selected for screening high RA stevia material EST-SSR primers. Key words: Stevia rebaudiana；EST-SSR molecular markers；genetic persity；RA；breeding 目录 摘要 1 关键词 1 Abstract 1 Key words 1 引言 1 1 材料与方法 2 1. 1 实验材料、试剂及仪器 2 1．1．1 实验材料 2 1．1．2 实验试剂 2 1．1．3 实验仪器 2 1．2 实验方法 2 1．2．1 甜叶菊采集 2 1．2．2 DNA提取 3 1．2．3 PCR扩增 3 1．2．3．1 PCR扩增前实验准备 3 1．2．3．2 PCR扩增反应体系及反应条件 3 1．2．3．3 PCR产物的电泳分离 4 2 结果与分析 4 2．1 DNA提取结果 4 2．2 PCR反应结果 5 2．2．1 以全池为模板PCR结果 5 2．2．2 以半池为模板PCR结果 6 2．2．3 以单个材料为模板PCR结果 10 2．3 遗传多样性分析 13 2.3.1 三类糖苷含量不同的甜叶菊类群间及个体间的遗传距离和聚类分析 13 2.3.2 甜叶菊遗传多样性分析 15 2.3.3 甜叶菊糖苷含量鉴别用引物 15 3 讨论 16 致谢 16 参考文献 16 图1 甜叶菊基因组DNA 4 图2 以全池为模板PCR结果 5 图3 以半池为模板PCR结果（1） 6 图3 以半池为模板PCR结果（2） 6 图3 以半池为模板PCR结果（3） 7 图3以半池为模板PCR结果（4） 7 图4 以半池为模板PAGE结果 9 图5 以单个材料为模板PCR结果（1） 10 图5 以单个材料为模板PCR结果（2） 10 图6 甜叶菊基因组DNA重提结果 11 图7 重提DNA的PCR结果 11 (责任编辑：qin) |