鹅ARHGAP21基因上SNP位点与产蛋性能的相关性研究
时间:2018-08-02 16:05 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
| 摘要：在鹅群的饲养中鹅的产蛋量是鹅群饲养的经济效益的主要影响因素，提高鹅的产蛋性能，对与饲养的经济效益以及育种进度等都有着很大的重要性。但是，鹅的产蛋性状是属于低遗传力的性状，使用传统的育种手段对于鹅的产蛋性能的提高效果有限，进展也比较缓慢。运用分子标记辅助选择（MAS）技术对这种低遗传力的性状的选择有着十分有效的作用，Rho GTPase激活蛋白21基因(ARHGAP21)对于细胞骨架，转录，细胞凋亡都有一定的影响，因此本课题根据简化基因组测序（RAD-sequencing）的结果筛选出鹅产蛋性能高低组之间ARHGAP21上等位基因频率差异显著的SNP，并在大群中进行运用AS-PCR分型，分析所得数据验证基因与产蛋性能的相关性，并使用实时荧光定量PCR（real time quantitative PCR）技术分析不同基因型对于mRNA水平的的影响。26606 毕业论文关键词：鹅；产蛋性能；ARHGAP21；SNP；荧光实时定量PCR Study on Relationship between SNPs in ARHGAP21 and Goose’s Laying Performance Abstract： Goose’s laying performance is the main influence factor of goose’s economic benefits. It is of great importance to improve the laying performance of geese both for raising economic benefits and breeding progress. However, the traits of goose’s laying performance are of low heritability, the use of traditional breeding methods to improve the performance of goose’s laying performance are limited, and the progress is relatively slow. Luckly, marker-assisted selection (MAS) strategy can play a very effective role in the selection of low heritability traits,and we know that Rho GTPase activating protein-21 (ARHGAP21) have a certain influence in transcription, cytoskeleton and cell apoptosis, so the topic use restriction site-associated DNA (RAD) sequencing technology to select significant different SNPs in ARHGAP21 between the goose laying performance group, and genotyping in the group with AS-PCR technology, then we analysis the data to verify the correlation between gene and laying performance. And we us the real time quantitative PCR technique to analyze the difference of mRNA level in different genotypes. Key words: goose；laying performance；ARHGAP21；SNP；real time quantitative PCR 目 录 摘要 1 关键词 1 Abstract. 1 Key words 1 引言 1 1 材料与方法 2 1．1 实验材料 2 1．1．1 实验动物 2 1．1．2 实验主要试剂 2 1．1．3 实验主要仪器 2 1．2 实验方法 3 1．2．1 使用简化基因组测序筛选出ARHGAP21上产蛋性能相关的SNP位点 3 1．2．2鹅血DNA提取液的配制（以1L为例） 3 1．2．3 鹅血中DNA的提取 3 1．2．4 DNA的质量鉴定 3 1．2．5 引物设计 3 1．2．6 AS-PCR 4 1．2．7 凝胶电泳 4 1．2．8 RNA提取 4 1．2．9 cDNA的合成 5 1．2．10 引物设计 5 1．2．11 实时荧光定量PCR 5 2 结果与分析 5 2．1测序结果 6 2．2 分型结果 6 2．3 荧光定量PCR结果 7 3 讨论 7 致谢 8 参考文献： 8 鹅ARHGAP21基因上SNP位点与产蛋性能的相关性研究 引言 鹅的产蛋性能在鹅的养殖中是十分重要的经济性状[1]。相比现有的大规模饲养的其他家禽，鹅有很强的抱性与较低的产蛋性能，这受到遗传、饲养管理、营养、环境以及应激在内的诸多因素的影响[2]。除了在饲养管理、改善营养及饲养环境这些方面来改善鹅的产蛋性能外，传统遗传选育方法对于鹅产蛋性能的改善是一直进展比较缓慢的，这是因为鹅的产蛋性状是一个低遗传力的性状，它的表型值受非遗传因素的影响较大，采用传统的遗传育种手段从表型上选育来提高鹅的产蛋性能进展比较缓慢，而且随着选育程度的提高，进展速度将越来越缓慢[3]。对于这种低遗传力的性状，运用分子标记选育技术（MAS）来选育是一种十分有效而理想的方法[1,4]。但用分子标记选育技术选育鹅首先得找到与目标性状相关的功能基因，为此，我们根据简化基因组测序技术结果先筛选出产蛋性能高低组中等位基因频率差异比较显著的SNP，对于该差异显著的SNP在大群中进行研究。 (责任编辑：qin) |