山楂叶螨的比较线粒体基因组学研究
时间:2018-09-18 20:29 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
| 摘要：蜱螨亚纲包括两个目：真螨总目和寄螨总目。在已知蜱螨亚纲种类线粒体中，寄螨总目绝大多数种类的线粒体基因组排列模式与节肢动物祖先排列模式保持一致，同时，线粒体基因组中tRNA也保持典型的三叶草二级结构；而在真螨总目线粒体基因组中发现其基因发生高度重排，线粒体tRNA长度极度缩短。为了探究真螨总目线粒体基因组进化特征，本研究对山楂叶螨进行全线粒体基因组扩增和测序，得到山楂叶螨线粒体基因组核酸序列总长13026 bp，环状闭合包含37个基因，其基因高度重排，线粒体tRNA极度缩短。通过与叶螨科、真螨目以及节肢动物线粒体基因组比较得到以下结论：1.基因数量正常没有缺失与增加；2.与叶螨科线粒体基因组排序一致，没有发生重排；3.trnI同时缺失D臂与T臂。28356 毕业论文关键词：山楂叶螨；线粒体基因组；重排 The research of mitochondrial genome in Amphitetranychus viennensis Abstract:The subclass Acari contains Acariformes and Parasitiformes. In subclass Acari have been sequenced, and the vast majority of send catalogue pattern mitochondrial genome and mite arthropod consistent, at the same time, in the mitochondrial genome tRNA also keep traditional clover secondary structure; Whereas Acariformes found in the mitochondrial genome rearrangement, mitochondrial tRNA extremely shortened. To explore the true mite superorder mitochondrial genome, this research will Amphitetranychus viennensis sequencing, get 13026 bp, hawthorn leaf mites mitochondrial genome chain ring closure contains 37 genes, the height of gene rearrangement, mitochondrial tRNA extremely shortened. With Tetranychidae, Acariformes and arthropods mitochondrial genome is get the following conclusions: 1. The growth in the number of genes and lacking normal; 2. Compared with the leaf mites secco mitochondrial genome sorting is consistent, no rearrangement; 3.trnI lacks both D-arm and T-arm. Key words:Amphitetranychus viennensis;mitochondrial genomes;rearrangement 目录 摘要1 关键词1 Abstract1 Key words1 引言1 1材料与方法2 1.1材料2 1.2实验方法2 1.2.1标本制作2 1.2.2基因测序2 1.2.3MtDNA提取2 1.2.4PCR体系的设置2 1.2.5电泳5 2结果分析5 2.1凝胶电泳结果5 2.2山楂叶螨线粒体基因组7 2.3山楂叶螨线粒体基因组排序8 2.4tRNA二级结构推测9 3讨论10 3.1基因重排10 3.2非典型tRNA二级结构11 致谢11 参考文献12 山楂叶螨的比较线粒体基因组学研究 引言 线粒体基因组具有一系列基因组水平的特征，如基因排序、RNA基因的二级结构以及复制和转录的控制模式等[1]，如今被广泛运用于种群遗传学、谱系地理学、分子进化、种系发生和比较及进化基因组学等多方面的研究[2-6]。如今对大多数的动物线粒体基因组都有了解，而对昆虫的线粒体基因组缺乏探究，尤其是螨类。典型的动物线粒体基因组是环状闭合的，有37个基因，但是在蜱螨亚纲已发现的39种寄螨总目中，有19种保留了祖先线粒体基因组排列模式，与此相比真螨总目中已知的27个种的线粒体基因组都发生了基因重排。 山楂叶螨属于蜱螨亚纲、真螨目、叶螨科。雌虫身体卵圆形，雄虫身体背面观呈菱形，体长0.4~0.6mm,有四对足，刺吸式口器。其在中国分布广泛，寄主广泛危害山楂、苹果、梨、桃、李等多种果树，是我国落叶果树的主要害螨之一，在我国北方果园危害较重。危害方式为吸食叶片与嫩芽的汁液，致使叶斑甚至叶片脱落，严重时影响产量。 本研究对山楂叶螨线粒体基因组进行扩增和测序，与典型动物线粒体基因组以及真螨总目线粒体基因组、叶螨总科线粒体基因组进行比较，探究其基因重排，tRNA结构变异等特点，为研究较少的螨类线粒体基因组增添一个种。从生物进化与基因规律方面，促进高阶元进化分析，验证叶螨科线粒体基因重排有着重要的意义。同时山楂叶螨对果树经济危害严重，对其研究也有着重要的经济价值。 (责任编辑：qin) |