蓖麻CKX基因家族生物信息学分析
时间:2018-09-23 20:45 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
摘要:随着世界能源危机的加剧,生物能源的开发利用已成为当今国际上的一大热点。蓖麻(Ricinus communis),大戟科,属一年生或多年生草本植物。蓖麻种子可榨油,蓖麻作为世界十大油料作物之一,具有很高的开发利用价值。对蓖麻CKX基因进行生物信息学分析,结果表明:CKX基因有6个成员,命名为RcCKX1、RcCKX3—RcCKX7,其中RcCKX1和RcCKX6,同源性高达70%,而RcCKX7与RcCKX4同源性仅为40%。因此通过对蓖麻CKX基因家族的生物信息学分析,将为蓖麻CKX基因功能研究奠定基础。28528 毕业论文关键词:蓖麻;细胞分裂素氧化酶(CKX);细胞分裂素(CK); 生物信息学 Bioinformatic analysis of the CKX gene family in Ricinus communis Abstract: With the intensification of the world's energy crisis, the development and utilization of bio-energy has become a hot topic in the international arena today. Castor bean (Ricinus communis), Euphorbiaceae, are annual or perennial herb. Castor seed oil extraction, castor oil crops as one of the world's top ten, with high development value. Castor CKX gene bioinformatics analysis showed that: CKX gene has six members, named RcCKX1, RcCKX3-RcCKX7, which RcCKX1 and RcCKX6, up to 70% homology, while RcCKX7 and RcCKX4 homology only 40%. Therefore, by Castor CKX gene family bioinformatics analysis, will lay the foundation castor CKX gene function studies. Keywords: Castor; cytokinin oxidase (CKX); cytokinin (CK); bioinformatics 目 录 摘要 1 引言 1 1.蓖麻与细胞分裂素简介 2 1 .1蓖麻研究概况 2 1.2 细胞分裂素研究概况 2 1.2.1 细胞分裂素的生物学特性 3 1.2.2 细胞分裂素的作用 3 1.3细胞分裂素氧化酶(CKX) 3 1.3.1细胞分裂素氧化酶特性 3 1.3.2 细胞分裂素氧化酶(CKX)种类 4 1.3.3细胞分裂素氧化酶的生理功能 4 1.4本研究的目的及意义 4 2.研究的方法及结果分析 4 2.1蓖麻CKX基因家族的系统进化树 4 2.2蓖麻RcCKX 基因家族间的同源性分析 6 2.3 RcCKX基因家族序列分析 7 2.4 RcCKX氨基酸序列结构域分析 12 3.讨论 13 4.结论 14 参考文献 14 致谢 17 蓖麻CKX基因家族生物信息学分析 引言 当今世界,一方面随着人口激增,人们所需要的能源越来越多,另一方面世界上的能源总量越来越少。因此如何找到更多的资源供人们生存,这是当今科学家亟需解决的问题。因此,越来越多的科学家将他们的目光转移到新能源的开发上,越来越多的科研人员也投入到相关领域的研究中,结果科学家们发现了蓖麻这样一种全是是宝的植物。蓖麻可作医用,也可生产生物柴油,其综合开发利用的经济价值极高[1]。因此尽可能的了解蓖麻的各种生物性状以及生长习性成为一项不可或缺的工作,我国是一个人口大国,对能源的需求巨大,因此大力发展新能源的研究对解决我国能源供需矛盾有着非常积极的作用。并且发展蓖麻产品的相关研究也能够创造大量就业机会和社会财富[2],而且我国发展蓖麻种植及其能源化利用有着得天独厚的自然资源和优势。细胞分裂素是植物体内一种重要的激素,对植物的生长、发育及作物产量起重要作用,研究发现细胞分裂素的含量与植物的产量有着明显的关联,提高植物体内的细胞分裂素的含量能够增加产量,细胞分裂素在抑制植物顶端生长,延缓植物衰老时间,促进种子发育等方面也能发挥作用,近些年还发现细胞分裂素在调节植物抗虫害、抗胁迫中也起重要作用[3],细胞分裂素氧化酶(CKX)基因最早是在玉米中发现的。来源不同的CKX 结构上可能存在一定的差异,但它们都有一段高度保守的氨基酸序列,保守区大多位于FAD区域。因此通过对蓖麻CKX基因家族生物信息学分析能够更好的了解蓖麻的CKX,为蓖麻的其它功能研究奠定基础并且做出大胆的预测。 (责任编辑:qin) |