TXNDC17基因的进化分析+文献综述(3)
时间:2017-05-26 10:15 来源:毕业论文 作者:毕业论文 点击:次
在NCBI数据库Gene中经查询，得到九种生物基因结构图（图1），通过分析基因结构图得到各种生物TXNDC17基因内含子与外显子的个数均为3个和4个，但九种生物的基因长度长短不等（表2），其中基因序列最长的是热带爪蟾，但其并不是最高等的生物，最短的是袋獾（不是低等生物），这表明基因序列的长短与生物是高等还是低等没有直接的关系。 人类基因结构图 袋獾基因结构图 地山雀基因结构图 斑马鱼基因结构图 锦龟基因结构图 热带爪蟾基因结构图 黄金蟒基因结构图 扬子鳄基因结构图 图1 九种生物基因结构图 Figure1 Genetic structure of nine creatures 表2 九种生物基因分析 Table2 Genetic analysis of nine creatures 物种 内含子（个） 外显子（个） Length (bp) Merged features 人类（Homo sapiens） 3 4 3,640 NP_116120.1 and NM_032731.3 袋獾（Sarcophilus harrisii） 3 4 1,058 XP_003766710.1 and XM_003766662.1 地山雀（Pseudopodoces humilis） 3 4 2,184 XP_005525700.1 and XM_005525643.1 斑马鱼（Danio rerio） 3 4 4,541 NP_001003456.1 and NM_001003456.1 锦龟（Chrysemys picta） 3 4 2,650 XP_006031347.1 and XM_006031285.1 热带爪蟾（Xenopus tropicalis） 3 4 9,852 XP_004911789.1 and XM_004911732.1 黄金蟒（Python bivittatus） 3 4 2,899 XP_007420950.1 and XM_007420888.1 扬子鳄（Alligator sinensis） 3 4 2,650 XP_006031347.1 and XM_006031285.1 腔棘鱼（Latimeria chalumnae） 3 4 3,645 XP_005987558.1 and XM_005987496.1 2.2 九种生物TXNDC17基因的比较和同源进化树的构建 人类基因序列分别与袋獾、地山雀、斑马鱼、锦龟、热带爪蟾、黄金蟒、扬子鳄和腔棘鱼该基因序列比对结果(图2)显示，表明该基因总体上不保守，相似性仅达到15.92%，说明该基因进化过程中分化较严重。运用DNAman软件对以上几种动物该基因序列进行进化树构建，如图3所示。结果表明人类和袋獾的亲缘关系最近，首先聚为一类，这一类与地山雀亲缘关系较近，又聚为一类，这一类与扬子鳄亲缘关系较近，又聚为一类，这一类与锦龟亲缘关系较近，又聚为一类，这一类与黄金蟒亲缘关系较近，这些生物共同聚为一大类。腔棘鱼与斑马鱼亲缘关系较近，聚为一类，这一类又与热带爪蟾亲缘关系较近，此三种生物聚为一大类，最后与第一大类归为一类。从这一分析可以得出结论，TXNDC17基因在进化的过程中主要分为两大分支，一类分支为硬骨鱼类、两栖类和腔棘鱼类；另一分支为哺乳动物（包括胎盘动物和有袋动物）、鸟类、海蜥蜴和鳄目。 (责任编辑：qin) |