β-葡萄糖苷酶cel1b的克隆研究(3)_毕业论文

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β-葡萄糖苷酶cel1b的克隆研究(3)

3 实验方法

3。1 cel1b和β-act的启动子(Pact)扩增的引物设计

(一)cel1b扩增的引物设计

根据cel1b的DNA片段序列,引物设计cel1b-Act-F为ATTAATCAGTCACAATGCCC GAGTCGCTAGCTCTGC,cel1b-R引物的序列为ATTATATATAAGCTTCGACAGAGAGGG GCCAAGGG,虚线部分为HindIII酶切位点,引物cel1b-Act-F和cel1b-R均为赛百盛基因技术有限公司合成。文献综述

(二)β-act启动子扩增的引物设计 

根据β-act启动子的DNA片段序列,引物设计Act-XbaI-F为TATATATATCTAGACACA GCAGAAGGGGGTTCCGTCAAC,虚线部分为XbaI 酶切位点,cel1b-Act-R为ACTCGGG CATTGTGACTGATTA ATGTATGAAGCTGATGAAAG,引物Act-XbaI-F和cel1b-Act-R均为赛百盛基因技术有限公司合成。

3。2 cel1b和Pact的PCR扩增

3。2。1 cel1b的PCR扩增

(一) 基因组DNA的提取

基因组DNA的提取采取CTAB法[11]。取冷冻菌丝,加液氮研磨至粉末状,移至离心管,加2ml的CTAB提取缓冲液(CTAB在65℃水浴预热),65℃保温1h,间或轻摇混匀。1h后以9000r/min的速度离心10min。然后小心吸取上清液,加入相同体积的氯仿:异戊醇溶液,抽提10min(涡旋混匀,放置10min),13000r/min,离心10min。取80%的上层液体(尽量多取)加相同体积预冷异丙醇,-20℃沉淀30min,10000rpm离心10min,之后取沉淀,加500µL NaAc。加入氯仿-异丙醇,-20℃沉淀30min,10000rpm离心10min。离心后去上清,用70%乙醇洗2次,加入300µL TER溶解。然后把溶液放置在4℃冰箱中备用。

(二)DNA聚合酶为Fastpfu酶的扩增

因Taq酶价格便宜,易出结果,并可以修正一些碱基的不配对,但错误率高,所以可用于PCR条件摸索实验中,而在条件确定后可改为保真性较高的Fastpfu酶,既保证扩增效率,又提高了保真性,可以合成较少的特异性弱的产物,正确率较高。PCR体系(25µL)为:19。6µL的H2O,2。5 µL 10×(Faspfu)buffer,1µL的基因组DNA,0。5µL的cel1b-Act-F,0。5µL的Cel1b-R和0。4µL的Fastpfu酶。PCR反应程序为:95℃,2min预变性;94℃,30s变性;60℃,20s退火;72℃,2min延伸。三步为一个循环,进行30个循环后,72℃延伸5min。将产物进行琼脂糖凝胶电泳。

(三)琼脂糖凝胶回收cel1b(exDNA导纳凝胶回收试剂盒)来*自-优=尔,论:文+网www.youerw.com

从凝胶中切要回收的cel1b条带,置于2ml离心管,称重加入3倍大小的Buffer DS。凝胶体积按1mg=1ml算。在上述试管中加入3ul exDNA Milk(使用时摇匀),置于55℃至凝胶溶解(注:如果胶溶解后变紫色,说明pH偏碱性,可加入少量3M醋酸钠(pH5。2),使溶解液变偏黄色,可提高回收效果。)将上述试管取出摇匀片刻,于最高速离心45s即可,去上清液,再取200ul Buffer DS将乳白色沉淀溶解,可在Vortex震荡,重复离心步骤得乳白色沉淀。取500µL Washing Buffer加入试管中洗涤沉淀。Vortex震荡,溶解后即离心45s。将所得沉淀再次洗涤,将上清液吸净,控干,可通风加速控干过程。(注:第一次洗涤后,沉淀可能不能很好地溶解,这并不影响回收效果。)沉淀控干后加入20µL双蒸水(或TE缓冲液),震荡溶解沉淀即可,离心,上清液即含回收DNA。

用Nanodrop法测回收DNA的浓度。其方法步骤为:打开电脑,选择Nanodrop2000程序软件,待初始化完成后选择“Nuclear acid”,进行初始化,之后在仪器的加样处先加入5µL TE Buffer洗涤,再加入1。5ml TE Buffer盖上盖子,点击“Black”选项,进行校零,用纸轻轻吸干样品孔的TE Buffer,最后加入1µL待测DNA溶液,合盖,点击“Measure”,电脑即可生成测量结果,通过260/280的值观察DNA纯度。 (责任编辑:qin)