DNA甲基化相关基因抗植物双生病毒研究(4)_毕业论文

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DNA甲基化相关基因抗植物双生病毒研究(4)

在室温下13000 rpm,离心30分钟,弃上清并且沥干。

11) 待酒精完全挥发后,管底呈透明后加入50 l的ddH2O,用于溶解DNA。

12) 用Nano Drop1000测定样品的DNA浓度。

1。2。2定量 PCR技术

1) 向96孔板中的每一个加样孔中加入5 l的SYBGreen反应液,0。5 l的上、下游引物和4 l的ddH2O。

2) 将96孔板放于漩涡仪下30 s,使体系充分混匀。

3) 4000 rpm,离心1 min。

4) 贴上膜,压平。

反应参数设置

T(℃) Duration

第一步 95 10 min

第二步 95 15 s

第三步 58 15 s

第四步 72 20 s

+Plate Read

第五步 GOTO 第二步

39  more times

第六步 Melt  Curve65 ℃ to 95 ℃,increment 0。5 ℃

For 5 s    +Plate Read

END

反应结束后,将PCR后的产物取5-10 l,进行电泳,检查扩增结果。

 1。2。3琼脂糖凝胶电泳

1) 配制胶液:使用天平称取1 g琼脂糖置于250 ml锥形瓶中,用量筒量取100 ml 1xTAE加入其中,为1 %的琼脂糖胶液;

2) 溶解:把胶液放入微波炉中高温加热使琼脂糖全部溶解,取出摇匀胶液;论文网

3) 胶板的制备:将溶解后的胶液进行冷却,并在冷却后约40-50 ℃的琼脂糖胶液中加入数滴Gel Red染料,混匀胶液然后倒入装好梳子的胶槽内,放置约20-30 min进行冷却;

4) 加样:先加入相对应的Marker,在按照顺序分别一一加入5-10 l的样品于样品槽中;

5) 电泳:恒电压190-220 V,电流控制在400 mA以上, 30 min电泳;

6) 观察和拍照:观察显示的电泳图,并保存。

1。2。4 病毒质粒的培养

1) 配制适量的LB培养基(常温下)待用;

2) 在提前紫外消毒过的超净工作台中,分别移取100 l的AMP(氨苄抗性)和TET(四环素抗性)置于两个培养基中;

3) 分别移取ACMV-A和ACMV-B病毒100 l于AMP培养基和TET培养基中;

4) 将两个培养基放于摇床中培养24 h;

5) 第二天取出待用于质粒的抽提;

 1。2。5 病毒质粒PCR

将采样后提取的基因组进行PCR扩增,按照如下的PCR,20 l体系进行加样。

2xMix 10 l

上游引物 1 l

下游引物 1l

DNA 1 l

ddH2O Upto 20 l

反应参数设置

T(℃) Duration Cycle

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