1。2 SBP家族的起源与进化
SBP转录因子家族是一类植物特有的重要转录因子,也是一类较晚发现的转录因子家族。最早是在研究金鱼草中发现的,并且在其花的早期发育中起调控作用[6],而由于这些转录因子是在金鱼草中识别SQUA基因的启动子并与之结合的试验中发现的,所以被称为SQUA启动子结合蛋白(SBP)。之后在拟南芥[7]、水稻[8]、大豆[9]和玉米[10]等植物物种中均发现有SBP转录因子家族成员的存在。此外,Cardon[11]等通过cDNA基因组文库筛选、原位杂交等方法,从金鱼草、拟南芥以及玉米中分离出了一组编码类似SBP蛋白的基因,这种类似于SBP蛋白的基因被命名为SPL基因,但这些基因的大多数功能尚未进行鉴定。到目前SBP基因已经从十余种植物中分离得到了,并且都含有一个共同的特征。最近通过SBP转录因子基因的进化分析表明SBP基因家族可能来源于一个共同的绿色祖先植物。
1。3 植物SBP基因家族的结构特征来自优I尔Q论T文D网WWw.YoueRw.com 加QQ7520~18766
在SBP转录因子家族中,它们都具有最主要的结构特点,即在它们的结构域中都具有一个高度保守的DNA结合域(SBP-DBD),而这个DNA结合区又称为SBP-box(SBP盒),其一般是由80个氨基酸残基组成,认为是CX4CX13HX5CQQCX3HX11C(富含Cys和His残基,其中有8个左右的保守的Cys或His残基共同构成了2个“锌-结合”位点[12])。大部分的锌-结合区是由4个Cys或His侧链组成的四面体来固定住一个Zn2+,最普遍也是最早被发现的锌-结合就是锌指结构:Cys2His2 zinc finger。Yam asaki等[13]通过磁共振的方法测定了拟南芥中两个SBP 结构域(SPL4, SPL7)的三维溶液构象,发现它们均含有2个锌指结构(zinc finger)和一个核定位信号(NLS)。
1。4 植物SBP基因家族的生物学功能
虽然植物的SBP转录因子家族是较晚发现的,但是具有许多重要的生物学功能,例如调控花和果实的生长发育、孢子的发育,抗霉菌的侵蚀和对激素的反应应答等等。在模式植物拟南芥中,SBP基因在花和叶片中高度表达,还参与花粉的发育 [14]。通过突变体的研究表明SBP转录因子主要参与花的生长和后期发育,叶的形态建成和环境信号应答 [15]。
1。5 研究意义
研究水稻的原因是水稻是继拟南芥之后第二个被全基因组测序的模式生物,并且还是禾本科植物的典型代表,更重要的是水稻是我国粮食的重要来源。而水稻产量的増加对国家有着重要的意义。已知道水稻株型是提高水稻产量的主要因素之一,也是决定水稻抗倒伏性的主要农艺性状,因此提高水稻产量的重要途径就是塑造理想的水稻株型。已经有研究表明控制水稻的理想株型的主要基因是IPA1,而这个基因编码一个含有SBP-box的转录因子(OsSPL14,Loc-Os 08g39890),参与调控生长发育。在营养生长和生殖生长阶段,OsSPL14始终在生长锥优势表达,在一二次枝梗也高度表达。这个转录因子若发生突变,会使水稻分蘗、穗粒数和干粒重増加,同时茎秆变粗壮抗倒伏性能增加,更能提高产量。由此可见,研究水稻SBP转录因子家族基因是一件重要的事情。水稻中的SBP转录因子家族除了OsSPL14,肯定还有其他的转录因子能够起一定的作用。所以研究水稻SBP基因家族,了解更多水稻中SBP转录因子家族的信息、与其他物种的进化关系以及其在不同时间不同组织中的表达情况,可以为塑造水稻的理想株型提供更多的情况,也为更进一步地了解SBP转录因子家族的情况奠定基础。
2 材料与方法论文网
2。1 SBP转录因子的数据获取与分析
2。1。1 SBP基因家族的数据获取 水稻SBP基因家族在植物中的进化分析(2):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_201872.html