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华鳈多态性EST微卫星标记的筛选(3)

时间:2021-12-16 19:14来源:毕业论文
15-20min,继续用冷冻离心机离心。来*自~优|尔^论:文+网www.youerw.com +QQ752018766* 6。离心后最后一次取上清液于新离心管中,再加入2倍体积的-20℃预冷无水乙醇

15-20min,继续用冷冻离心机离心。来*自~优|尔^论:文+网www.youerw.com +QQ752018766*

6。离心后最后一次取上清液于新离心管中,再加入2倍体积的-20℃预冷无水乙醇,立即上 下翻转混合至絮状DNA出现。

7。最后一次进行离心,后缓慢倒出酒精至酒精挥发完,再用70%的酒精洗两次,并根据DNA 沉淀量加入200ul-400ulTE缓冲液溶解DNA,置于摇床缓慢摇动12h以上促进DNA溶解。

8。最后使用NanoDrop 2000微量分光光度计检测浓度,-20℃保存备用。

2。2  EST-SSR 引物设计与合成

本研究是从转录组测序 EST 序列中利用 SSRHunter 软件查找三碱基至六碱基重复的微 卫星序列,重复次数设置在 7 次以上,然后将获得的微卫星序列进行引物设计,引物设计 采用相应设计软件 Primer5,设计引物时注意事项参照张新宇等[11]的引物设计技巧,引物 片段大小在 18-27bp,引物序列 GC 含量一般在 40%-60%,Tm 值控制在 40-60 度,产物片 段长度在 100bp-400bp 之间,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

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