基于线粒体基因的截形叶螨种群遗传结构研究摘要：截形叶螨Tetranychus truncatus Ehara 是一种广泛分布于中国各地区，为害农林作物的重要经济害虫，它属于蛛形纲Arachnida、蜱螨亚纲Acari、真螨目Acariformes、叶螨科Tetranychidae。较早研究表明，对于物种的种群遗传研究一般基于多种分子标记来实现，其中包括mtDNA、单拷贝基因以及微卫星等。为了更好的了解中国截形叶螨的种群遗传结构，本次研究一共采集了10个分布于全国各地的不同的地理种群的截形叶螨共377头截形叶螨进行mtDNA单倍型分析，共发现10个线粒体单倍型，各个单倍型中碱基AT含量高于CG，所占比80。9%~81。2%，10个单倍型共有10个多态型位点。Fst结果显示大部分地理种群两两之间都呈现差异显著。同时，AMOVA结果表明截形叶螨种间大约占总变异的68。40%，说明其种群间具有较大的变异程度。81755
毕业论文关键词： 截形叶螨；mtDNA；多样性；Cytb；遗传变异
Study of the genetic structure of Tetranychus truncatus Ehara based on mitochondrial DNA
Abstract：The Tetanychus truncatus Ehara，which belongs to Arachnida，Acari，Acariformes，Tetranychidae，Tetranychus，is one of the most crucial and far-flung mite pests in agriculture and forest。 Earlier studies have shown that populations of the species for genetic studies based on various molecular markers to achieve, including microsatellites, single-copy nuclear genes, mtDNA and so on。 For better known the Population genetic structure of Tetanychus truncates, we collected 10 different sites’ population of Tetanychus truncates among 377 insects for this study, we found 10 diferent Polymorphic sites in mtDNA-Cytb haplotypes, and each polymorphic sites’ AT base is more than CG base, between 80。9 per cent and 81。2 percent。 Meanwhile, the analysis of AMOVA indicated that the molecular variance of Cytb in population of Tetranychus truncatus Ehara almost in 68。40 per cent of all, which means it’s a huge variation in Natural population of Tetanychus truncates。
Key words: Tetanychus truncates ; mtDNA ;dversity;Cytb; genetic variation
目 录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言4
1材料与方法5
1。1样品采集 5
1。2实验室虫源 5
1。3 DNA提取5
1。4截形叶螨的mtDNA-Cytb序列扩增及测序7
1。5序列分析及数据处理7
2结果与分析7
2。1 mtDNA-Cytb序列分析7
2。2 mtDNA-Cytb序列多样性分析 9
2。3基于mtDNA-Cytb的截形叶螨的种群分化11
3讨论11
参考文献13
在研究中，一般将对遗传多样性（genetic persity）的研究作为对物种进化研究的基础，同时这也为研究生物多样性等方面提供了依据。遗传多样性以及其变化规律对于自然生物资源的研究也是十分重要的。在自然界中存在着多种影响种群遗传多样性的因素，包括有效种群大小、基因突变率以及基因流动等[1]。在昆虫研究的领域之中，Fisher 和Willianm二人在1943年最早地提出了生物多样性的这个概念。随后，Norse等[2]又提出了可以将生物多样性分成三个水平来进行分析的概念，首先是从种群到物种，接下来是从物种到生态系统，而且这三者也分别对应遗传多样性、物种多样性以及生态系统多样性。由于外界环境压力以及基因转移等多方面的原因，种群的多样性一直处于进化的过程中[3]。
线粒体是一种在细胞生命周期中为细胞提供所需的能量的结构，因此其在生命体内具有至关重要的作用。线粒体中存在一个较小的基因组，并且其基因组为母系遗传。在昆虫中，线粒体基因组大小一般在 14~19kb，并且存在着非常高的拷贝数。昆虫线粒体基因组包括13个编码蛋白的基因（其中包括NADH-Q还原酶、编码细胞色素氧化酶C、编码细胞色素氧化酶b以及ATP合成酶的多个亚基），2个rRNAs以及 22 个tRNAs（其作用为运输线粒体蛋白），共含有37个编码基因。同时，在较早的研究中表明线粒体DNA碱基组成具有明显的AT偏好性，其中分类地位越高的类群其GC的含量则越高，对于无脊椎动物，尤其是昆虫，其线粒体DNA碱基中就明显表现为AT含量很高，而相较起来GC含量 线粒体基因的截形叶螨种群遗传结构研究:http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_95662.html