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截形叶螨线粒体种群遗传结构与体内共生菌的关系研究(3)

时间:2022-06-27 21:41来源:毕业论文
提取DNA的具体方法是: (1)首先分别在1。5 mL离心管中加入30L的Buffer ATL,接着用毛笔尖挑取一只雌性成螨置于离心管的Buffer ATL溶液中,每管保证只有一头

提取DNA的具体方法是:

(1)首先分别在1。5 mL离心管中加入30μL的Buffer ATL,接着用毛笔尖挑取一只雌性成螨置于离心管的Buffer ATL溶液中,每管保证只有一头雌螨。用一次性研磨棒进行充分研磨,再向其中加入150μL Buffer ATL,加入时同时注意冲洗研磨棒;

(2)随后向每管中分别加入20μL的蛋白酶K,并且充分震荡离心,于56℃水浴中孵育3小时,直到叶螨的可见组织完全被消解。

(3)首先涡旋混匀15s,再向其中分别加入200μL的Buffer AL后,再次涡旋充分混匀离心。值得注意的事,如果在此过程中看到沉淀,则需要放入56℃水浴中进行加热,大约在10分钟左右沉淀即能消失。随后加入200μL的100%无水乙醇后,再次充分涡旋离心。

(4)将所得的混合液全部转移至装有Dneasy过滤柱的洁净的2mL收集管中,在离心机中以13000g转速离心1min,离心完毕后弃滤液以及收集管。

(5)将过滤柱放入新的收集管中,随后向柱中加入Buffer AW1 500μL, 在离心机中离心1min以13000g的转速,随后弃滤液和收集管。

(6)将过滤柱继续放入新的收集管中,往柱中加入Buffer AW2 500μL, 在离心机中离心3min以20000g转速,随后弃滤液和收集管。

(7)最后,把过滤柱置入新的1。5mL离心管中,分别加入去离子水各100μL,室温等待2~3分钟后在离心机中离心1min,以13000g的转速,过滤后即为所需要的叶螨DNA,于-20℃下保存备用或者直接进行PCR。

1。4 mtDNA-cytb与wsp基因的扩增及测序

通过Wolbachia上的wsp基因扩增来对样本中的Wolbachia进行检测。

上游引物:TGGTCCAATAAGTGATGAAGAAAC

下游引物:来;自]优Y尔E论L文W网www.youerw.com +QQ752018766-ATTAAACGCTTACTCCA

扩增反应体系:20μL

表1 wsp基因扩增体系成分表

组分 体积(μL)

ddH2O 7。9

Mix 10

上游引物(25μmol/L) 0。3

下游引物(25μmol/L)

DNA模板 0。3

1。5

扩增条件为:

95℃ 2min 

95℃ 30s 

54℃ 30s 

72℃ 45s 

72℃ 10min

12℃ ∞  (阳性对照为Wolbachia溶液,阴性对照为水。)

设计引物对mtDNA-cytb进行扩增及测序

上游引物:ATAACTATAACATCAGCTTTTATAGG

下游引物:TAAAGTTATAACT来;自]优Y尔E论L文W网www.youerw.com +QQ752018766-TTATAATTAATCC

扩增反应体系:25μL

表2 mtDNA-cytb扩增体系成分表

组分 体积(μL)

ddH2O 10。5

10×buffer 12。5

E(5U/μL) 0。5

上游引物(25μmol/L) 0。25

上游引物(25μmol/L) 0。25

DNA模板 1

扩增条件为:

94℃ 1min

98℃ 10s 

55℃ 15s 

68℃ 1min

68℃ 10min

12℃ ∞

在得到扩增产物之后,通过琼脂糖凝胶电泳对其进行质量检测,步骤是:

取出之前得到的PCR扩增产物5μL,在2。0%(g/ml)的琼脂糖凝胶上进行电泳检测。电泳检测使用的缓冲液是1×TAE,整个电泳过程中,电压为130V,在电泳20分钟后通过Bio-Rad Gel Doc EQ的凝胶成像系统对电泳结果进行观察并拍照记录。 截形叶螨线粒体种群遗传结构与体内共生菌的关系研究(3):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_95665.html

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