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（三）催收欠缴学费不力
目前，我国高校的学费收缴已经变成了一项十分重要的财务工作。如果学校可以把学费按时足额地收上来，就能从根本上缓解学校经费短缺的状况，对于高校的建设和日常的教学工作都会起到积极的推动作用。最终达到提高学校办学水平和教学质量的目的。但是我国高校普遍存在学费收缴难的问题。据统计，当前我国高校在校生的欠费率高达10%左右，并且还有继续上升的趋势。由于欠费额度的巨大，已经很大程度的影响了高校正常教学工作的开展。高校学费收缴难的问题，已经变成了我国高校财务管理需要解决的主要问题。
（四）缺乏有效的监督体制
高校的出资人主要是国家,但不对其进行财务管理,不要求其偿还其提供的资产,也不参与经济上的分配,造成投资的所有者缺失。高校管理者独立行使法定权利,但不承担具体的受托责任,这必然使高校缺少进行成本核算和提高投资效益的外界压力,导致资源缺乏有效的管理与监督。另外，我国高校实行的是委领导下的校长负责制,其初衷是对高校决策权与执行权进行分离,即委被授予决策权,校长被授予执行权,两者相互制衡。但在实践中,这种权利分配方面的平衡经常被打破,使高校管理机制出现漏洞和权利约束机制失控。同时，我国高校内部控制体制不健全，上下级权限划分不明确，容易出现“权力真空”的现象，妨碍高等学校资金运动、资金循环的正常进行。高校中各部门各自为阵，资金分散。这些严重影响了教职工的工作积极性，对高校的正常发展产生了不利影响。因此,高校在融投资上缺乏科学的统筹规划和民主的决策程序,资金的使用不能严格按照预算执行。
（五）预算编制不完善
目前，我国一些高校没有树立起科学的预算管理理念，重预算编制轻预算的执行。首先，在实际工作中，存在各部门预算和高校内部预算脱节的现象，编制预算与执行预算脱节，预算项目没有尽可能细化，预算支出没有科学的定额和标准。预算编制时间过短，预算编制过程透明度不高等原因造成了部门预算不准确、预算内容不全面。有时编制的部门预算没有客观反映学校财务收支全貌和体现学校的工作重点和发展方向。其次，高校缺失对“债务预算”的管理规定，导致目前高校预算和会计核算之间有很大差别，使高校的举债问题难以处理，预算编制基础面临挑战。最后，在预算执行上存在没有建立相应的跟踪、分析和评价制度，对各部门的预算经费难以做出准确、具体的分析评价，对资金的使用效益也难以正确、完整的评价的情况。预算执行中还存在预算内容不实、预算约束不强和预算执行不了的情况。一些学校对于各项事业经费，在使用上往往事先无计划，缺乏统筹安排，对全年业务开支存在着很大的盲目性；在资金使用过程中无控制，不管对事业发展是否需要，只要领导批字就全部报销。资金的使用缺乏计划性，因而导致资金使用不合理，使一些主要工作因缺乏资金不能按期完成，影响了事业的发展。
三、我国高校财务管理出现问题的原因
（一）高校债务风险原因分析
高校出现债务风险的原因是多方面的，下面从政府、高校、银行三个方面分析高校贷款现状出现的原因。
（1）国家财政投入不足
随着我国高校办学规模不断的扩大,高校需要投入的教育经费和成本也在持续增加,而我国教育性财政投入还不能满足高校的资金需求。近几年，虽然我国财政性教育经费投入占GDP的比例有所提高（2007年至2010年,分别为3.32%、3.33%、3.59%、3.66%），财政性教育经费的投入占GDP的比例保持在3.5%上下,但是这一比例却仍然低于世界平均水平( 7% ) ,更远低于发达国家( 9% ）,甚至不及经济欠发达国家( 4.1%) 。与此同时，近两年国家的财政性教育经费更是偏向发展学前教育和九年义务教育,导致高校从本来就有限的财政教育经费中得到的份额越来越少,国家教育性财政投入确实无法满足我国高校发展的现实需求。