题目:苯并噻唑类似物抑制T3151野生和突变的Bcr-Abl激酶的计算机辅助药物设计研究
专业:应用化学
任务起至日期:
一、课题的任务内容:
本论文将采用3D-QSAR法,在SYBYL-X 2.0的水平下,以部分分子结构和生物活性(pIC50值)已知的苯并噻唑类似物分子为训练集, 选用此系列分子的各种分子力场(立体场、静电场、疏水场、氢键供体场、氢键受体场等) 用三文定量构效关系(3D-QSAR) 方法建立反映分子结构与生物活性之间的定量构效关系模型。并基于此模型来设计新的苯并噻唑类似物分子和进行结构修饰。
二、原始条件及数据:34710
原始资料来自于文献和指导教师提供的资料
三、设计的技术要求(论文的研究要求):
建立具有显著统计学意义,预测能力良好的3D-QSAR模型
四、毕业设计(论文网)应完成的具体工作:
1.分子结构的搭建;
2.分子结构的优化;
3.分子的叠合;
4.3D-QSAR模型的建立;
5.模型的有效性检验、新型活性分子设计及结构修饰。
软硬件名称、内容及主要的技术指标(可按以下类型选择):
计算机软件
SYBYL-X 2.0
结 构 模 型 √
五、查阅文献要求及主要的参考文献:
要求:查阅中文文献13篇,外文文献13篇以上
主要参考文献:
1. Discovery of new benzothiazole-based inhibitors of breakpoint cluster region- ablelson kinase including the t315i mutant
Seunghee Hong,Jinhee kim, Sun-Mi Yun,Hyunseung Lee, Yoonsu Park, Soon-Sun Hong and Sungwoo Hong
2. Disovery of Picomolar ABL Kinase Inhibitors Equipotent For Wild type and T135I mutant via structure-based de Novo Design
Hwangseo Park ,Seunghee Hong, Jinhee Kim and Sungwoo Hong
优尔、进度安排:(设计或论文各阶段的要求,时间安排):
求计算机应用能力和英语阅读能力较强 工作计划:要求完成下列内容: 1.分子结构的搭建; 2.分子结构的优化; 3.分子的叠合;4.3D-QSAR模型的建立;5.模型的有效性检验、新型活性分子设计及结构修饰。 工作计划: 第1周 — 第3周 查阅文献和收集资料。 第4周 — 第13周 分子结构的搭建、优化、模型的建立与验证 第14周 — 第15周 新型活性分子设计及结构修饰 第16周 — 第18周 撰写论文,准备答辩。
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